Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7D5

Arhgef5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef5E9Q7D5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC64.28■■■■■ 7.88
Arhgef5E9Q7D5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC60.24■■■■■ 7.23
Arhgef5E9Q7D5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.96■■■■■ 7.03
Arhgef5E9Q7D5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC56.55■■■■■ 6.64
Arhgef5E9Q7D5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC54.76■■■■■ 6.36
Arhgef5E9Q7D5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.41■■■■■ 6.3
Arhgef5E9Q7D5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC54.38■■■■■ 6.3
Arhgef5E9Q7D5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.3■■■■■ 6.28
Arhgef5E9Q7D5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.6■■■■■ 6.17
Arhgef5E9Q7D5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC53.44■■■■■ 6.14
Arhgef5E9Q7D5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC53.43■■■■■ 6.14
Arhgef5E9Q7D5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC53.18■■■■■ 6.1
Arhgef5E9Q7D5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.85■■■■■ 6.05
Arhgef5E9Q7D5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.85■■■■■ 6.05
Arhgef5E9Q7D5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC52.75■■■■■ 6.03
Arhgef5E9Q7D5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC52.44■■■■■ 5.99
Arhgef5E9Q7D5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.09■■■■■ 5.93
Arhgef5E9Q7D5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.47■■■■■ 5.83
Arhgef5E9Q7D5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC51.33■■■■■ 5.81
Arhgef5E9Q7D5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC51.19■■■■■ 5.78
Arhgef5E9Q7D5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.13■■■■■ 5.78
Arhgef5E9Q7D5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.11■■■■■ 5.77
Arhgef5E9Q7D5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51■■■■■ 5.75
Arhgef5E9Q7D5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC50.66■■■■■ 5.7
Arhgef5E9Q7D5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.3■■■■■ 5.64
Arhgef5E9Q7D5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.21■■■■■ 5.63
Arhgef5E9Q7D5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC50.21■■■■■ 5.63
Arhgef5E9Q7D5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50■■■■■ 5.6
Arhgef5E9Q7D5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC49.69■■■■■ 5.54
Arhgef5E9Q7D5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC49.65■■■■■ 5.54
Arhgef5E9Q7D5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC49.33■■■■■ 5.49
Arhgef5E9Q7D5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC49.27■■■■■ 5.48
Arhgef5E9Q7D5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC49.19■■■■■ 5.46
Arhgef5E9Q7D5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.15■■■■■ 5.46
Arhgef5E9Q7D5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC49.12■■■■■ 5.45
Arhgef5E9Q7D5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC48.94■■■■■ 5.43
Arhgef5E9Q7D5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.85■■■■■ 5.41
Arhgef5E9Q7D5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC48.83■■■■■ 5.41
Arhgef5E9Q7D5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC48.75■■■■■ 5.39
Arhgef5E9Q7D5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC48.62■■■■■ 5.37
Arhgef5E9Q7D5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.56■■■■■ 5.36
Arhgef5E9Q7D5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC48.43■■■■■ 5.34
Arhgef5E9Q7D5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.35■■■■■ 5.33
Arhgef5E9Q7D5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.31■■■■■ 5.32
Arhgef5E9Q7D5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.27■■■■■ 5.32
Arhgef5E9Q7D5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.13■■■■■ 5.3
Arhgef5E9Q7D5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.07■■■■■ 5.29
Arhgef5E9Q7D5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.04■■■■■ 5.28
Arhgef5E9Q7D5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.03■■■■■ 5.28
Arhgef5E9Q7D5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC47.98■■■■■ 5.27
Arhgef5E9Q7D5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC47.96■■■■■ 5.27
Arhgef5E9Q7D5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.93■■■■■ 5.26
Arhgef5E9Q7D5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC47.9■■■■■ 5.26
Arhgef5E9Q7D5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
Arhgef5E9Q7D5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC47.81■■■■■ 5.24
Arhgef5E9Q7D5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC47.8■■■■■ 5.24
Arhgef5E9Q7D5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC47.67■■■■■ 5.22
Arhgef5E9Q7D5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC47.62■■■■■ 5.21
Arhgef5E9Q7D5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC47.59■■■■■ 5.21
Arhgef5E9Q7D5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.5■■■■■ 5.19
Arhgef5E9Q7D5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC47.28■■■■■ 5.16
Arhgef5E9Q7D5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC47.28■■■■■ 5.16
Arhgef5E9Q7D5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC46.96■■■■■ 5.11
Arhgef5E9Q7D5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
Arhgef5E9Q7D5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC46.93■■■■■ 5.1
Arhgef5E9Q7D5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC46.9■■■■■ 5.1
Arhgef5E9Q7D5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.77■■■■■ 5.08
Arhgef5E9Q7D5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC46.77■■■■■ 5.08
Arhgef5E9Q7D5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
Arhgef5E9Q7D5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC46.63■■■■■ 5.06
Arhgef5E9Q7D5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
Arhgef5E9Q7D5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC46.56■■■■■ 5.04
Arhgef5E9Q7D5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
Arhgef5E9Q7D5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
Arhgef5E9Q7D5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
Arhgef5E9Q7D5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
Arhgef5E9Q7D5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC46.44■■■■■ 5.03
Arhgef5E9Q7D5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
Arhgef5E9Q7D5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC46.39■■■■■ 5.02
Arhgef5E9Q7D5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
Arhgef5E9Q7D5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC46.26■■■■■ 5
Arhgef5E9Q7D5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
Arhgef5E9Q7D5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
Arhgef5E9Q7D5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
Arhgef5E9Q7D5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
Arhgef5E9Q7D5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC46.07■■■■■ 4.97
Arhgef5E9Q7D5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
Arhgef5E9Q7D5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
Arhgef5E9Q7D5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
Arhgef5E9Q7D5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC45.88■■■■■ 4.94
Arhgef5E9Q7D5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
Arhgef5E9Q7D5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
Arhgef5E9Q7D5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.83■■■■■ 4.93
Arhgef5E9Q7D5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
Arhgef5E9Q7D5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.92
Arhgef5E9Q7D5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC45.73■■■■■ 4.91
Arhgef5E9Q7D5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC45.73■■■■■ 4.91
Arhgef5E9Q7D5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC45.71■■■■■ 4.91
Arhgef5E9Q7D5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC45.68■■■■■ 4.9
Arhgef5E9Q7D5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
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