Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC64.7■■■■■ 7.95
Fgd6Q69ZL1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC60.28■■■■■ 7.24
Fgd6Q69ZL1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.23■■■■■ 7.07
Fgd6Q69ZL1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC56.57■■■■■ 6.65
Fgd6Q69ZL1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC55.61■■■■■ 6.49
Fgd6Q69ZL1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.72■■■■■ 6.35
Fgd6Q69ZL1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC54.52■■■■■ 6.32
Fgd6Q69ZL1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC54.29■■■■■ 6.28
Fgd6Q69ZL1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.21■■■■■ 6.27
Fgd6Q69ZL1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.12■■■■■ 6.26
Fgd6Q69ZL1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC53.87■■■■■ 6.21
Fgd6Q69ZL1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC53.03■■■■■ 6.08
Fgd6Q69ZL1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.59■■■■■ 6.01
Fgd6Q69ZL1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC52.57■■■■■ 6.01
Fgd6Q69ZL1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC52.47■■■■■ 5.99
Fgd6Q69ZL1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.31■■■■■ 5.96
Fgd6Q69ZL1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.96■■■■■ 5.91
Fgd6Q69ZL1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.61■■■■■ 5.85
Fgd6Q69ZL1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC51.48■■■■■ 5.83
Fgd6Q69ZL1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC51.43■■■■■ 5.82
Fgd6Q69ZL1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.39■■■■■ 5.82
Fgd6Q69ZL1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC51.38■■■■■ 5.82
Fgd6Q69ZL1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.4■■■■■ 5.66
Fgd6Q69ZL1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC50.18■■■■■ 5.62
Fgd6Q69ZL1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.07■■■■■ 5.61
Fgd6Q69ZL1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.99■■■■■ 5.59
Fgd6Q69ZL1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.98■■■■■ 5.59
Fgd6Q69ZL1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.81■■■■■ 5.56
Fgd6Q69ZL1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC49.65■■■■■ 5.54
Fgd6Q69ZL1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC49.63■■■■■ 5.54
Fgd6Q69ZL1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.53■■■■■ 5.52
Fgd6Q69ZL1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC49.46■■■■■ 5.51
Fgd6Q69ZL1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.4■■■■■ 5.5
Fgd6Q69ZL1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC49.11■■■■■ 5.45
Fgd6Q69ZL1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC49.09■■■■■ 5.45
Fgd6Q69ZL1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.92■■■■■ 5.42
Fgd6Q69ZL1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC48.91■■■■■ 5.42
Fgd6Q69ZL1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC48.88■■■■■ 5.41
Fgd6Q69ZL1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.87■■■■■ 5.41
Fgd6Q69ZL1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC48.8■■■■■ 5.4
Fgd6Q69ZL1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.8■■■■■ 5.4
Fgd6Q69ZL1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC48.79■■■■■ 5.4
Fgd6Q69ZL1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.77■■■■■ 5.4
Fgd6Q69ZL1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.59■■■■■ 5.37
Fgd6Q69ZL1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC48.56■■■■■ 5.36
Fgd6Q69ZL1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.51■■■■■ 5.36
Fgd6Q69ZL1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC48.51■■■■■ 5.36
Fgd6Q69ZL1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC48.45■■■■■ 5.35
Fgd6Q69ZL1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC48.43■■■■■ 5.34
Fgd6Q69ZL1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.43■■■■■ 5.34
Fgd6Q69ZL1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC48.32■■■■■ 5.33
Fgd6Q69ZL1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC48.27■■■■■ 5.32
Fgd6Q69ZL1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.25■■■■■ 5.31
Fgd6Q69ZL1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC48.01■■■■■ 5.28
Fgd6Q69ZL1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
Fgd6Q69ZL1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.77■■■■■ 5.24
Fgd6Q69ZL1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC47.74■■■■■ 5.23
Fgd6Q69ZL1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC47.62■■■■■ 5.21
Fgd6Q69ZL1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.6■■■■■ 5.21
Fgd6Q69ZL1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC47.5■■■■■ 5.2
Fgd6Q69ZL1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
Fgd6Q69ZL1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC47.4■■■■■ 5.18
Fgd6Q69ZL1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.16
Fgd6Q69ZL1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
Fgd6Q69ZL1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
Fgd6Q69ZL1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC47.1■■■■■ 5.13
Fgd6Q69ZL1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC47.08■■■■■ 5.13
Fgd6Q69ZL1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
Fgd6Q69ZL1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
Fgd6Q69ZL1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
Fgd6Q69ZL1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC46.91■■■■■ 5.1
Fgd6Q69ZL1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
Fgd6Q69ZL1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC46.82■■■■■ 5.09
Fgd6Q69ZL1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
Fgd6Q69ZL1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC46.75■■■■■ 5.07
Fgd6Q69ZL1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
Fgd6Q69ZL1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
Fgd6Q69ZL1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
Fgd6Q69ZL1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC46.28■■■■■ 5
Fgd6Q69ZL1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.26■■■■■ 5
Fgd6Q69ZL1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
Fgd6Q69ZL1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC46.2■■■■■ 4.99
Fgd6Q69ZL1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
Fgd6Q69ZL1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC46.17■■■■■ 4.98
Fgd6Q69ZL1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC46.15■■■■■ 4.98
Fgd6Q69ZL1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC46.07■■■■■ 4.97
Fgd6Q69ZL1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC46.06■■■■■ 4.96
Fgd6Q69ZL1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.05■■■■■ 4.96
Fgd6Q69ZL1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
Fgd6Q69ZL1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
Fgd6Q69ZL1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.99■■■■■ 4.95
Fgd6Q69ZL1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
Fgd6Q69ZL1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC45.99■■■■■ 4.95
Fgd6Q69ZL1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.99■■■■■ 4.95
Fgd6Q69ZL1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC45.98■■■■■ 4.95
Fgd6Q69ZL1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
Fgd6Q69ZL1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC45.96■■■■■ 4.95
Fgd6Q69ZL1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC45.96■■■■■ 4.95
Fgd6Q69ZL1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
Fgd6Q69ZL1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms