Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC60.08■■■■■ 7.21
Ncapd3Q6ZQK0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC55.88■■■■■ 6.54
Ncapd3Q6ZQK0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.98■■■■■ 6.39
Ncapd3Q6ZQK0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC52.48■■■■■ 5.99
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC51.86■■■■■ 5.89
Ncapd3Q6ZQK0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.45■■■■■ 5.83
Ncapd3Q6ZQK0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.84■■■■■ 5.73
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC50.67■■■■■ 5.7
Ncapd3Q6ZQK0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC50.63■■■■■ 5.7
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.48■■■■■ 5.67
Ncapd3Q6ZQK0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC50.11■■■■■ 5.61
Ncapd3Q6ZQK0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.06■■■■■ 5.61
Ncapd3Q6ZQK0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.03■■■■■ 5.6
Ncapd3Q6ZQK0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.62■■■■■ 5.53
Ncapd3Q6ZQK0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC49.04■■■■■ 5.44
Ncapd3Q6ZQK0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.66■■■■■ 5.38
Ncapd3Q6ZQK0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.63■■■■■ 5.37
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC48.54■■■■■ 5.36
Ncapd3Q6ZQK0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.45■■■■■ 5.35
Ncapd3Q6ZQK0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.27■■■■■ 5.32
Ncapd3Q6ZQK0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.04■■■■■ 5.28
Ncapd3Q6ZQK0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC47.99■■■■■ 5.27
Ncapd3Q6ZQK0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.86■■■■■ 5.25
Ncapd3Q6ZQK0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.77■■■■■ 5.24
Ncapd3Q6ZQK0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC47.76■■■■■ 5.24
Ncapd3Q6ZQK0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC47.69■■■■■ 5.22
Ncapd3Q6ZQK0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC47.63■■■■■ 5.22
Ncapd3Q6ZQK0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC47.34■■■■■ 5.17
Ncapd3Q6ZQK0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
Ncapd3Q6ZQK0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
Ncapd3Q6ZQK0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.89■■■■■ 5.1
Ncapd3Q6ZQK0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.77■■■■■ 5.08
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.56■■■■■ 5.04
Ncapd3Q6ZQK0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
Ncapd3Q6ZQK0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC46.54■■■■■ 5.04
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
Ncapd3Q6ZQK0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
Ncapd3Q6ZQK0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
Ncapd3Q6ZQK0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC46.28■■■■■ 5
Ncapd3Q6ZQK0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
Ncapd3Q6ZQK0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC46.23■■■■■ 4.99
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC46.06■■■■■ 4.96
Ncapd3Q6ZQK0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC45.98■■■■■ 4.95
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.94
Ncapd3Q6ZQK0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
Ncapd3Q6ZQK0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
Ncapd3Q6ZQK0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
Ncapd3Q6ZQK0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC45.6■■■■■ 4.89
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC45.52■■■■■ 4.88
Ncapd3Q6ZQK0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC45.52■■■■■ 4.88
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC45.34■■■■■ 4.85
Ncapd3Q6ZQK0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
Ncapd3Q6ZQK0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC45.23■■■■■ 4.83
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC45.12■■■■■ 4.81
Ncapd3Q6ZQK0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.1■■■■■ 4.81
Ncapd3Q6ZQK0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
Ncapd3Q6ZQK0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC45.01■■■■■ 4.8
Ncapd3Q6ZQK0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
Ncapd3Q6ZQK0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.93■■■■■ 4.78
Ncapd3Q6ZQK0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC44.92■■■■■ 4.78
Ncapd3Q6ZQK0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
Ncapd3Q6ZQK0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
Ncapd3Q6ZQK0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC44.75■■■■■ 4.75
Ncapd3Q6ZQK0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
Ncapd3Q6ZQK0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC44.68■■■■■ 4.74
Ncapd3Q6ZQK0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
Ncapd3Q6ZQK0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.74
Ncapd3Q6ZQK0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
Ncapd3Q6ZQK0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
Ncapd3Q6ZQK0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
Ncapd3Q6ZQK0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC44.37■■■■■ 4.69
Ncapd3Q6ZQK0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC44.34■■■■■ 4.69
Ncapd3Q6ZQK0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC44.29■■■■■ 4.68
Ncapd3Q6ZQK0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
Ncapd3Q6ZQK0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC44.17■■■■■ 4.66
Ncapd3Q6ZQK0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
Ncapd3Q6ZQK0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC44.04■■■■■ 4.64
Ncapd3Q6ZQK0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
Ncapd3Q6ZQK0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
Ncapd3Q6ZQK0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC43.87■■■■■ 4.61
Ncapd3Q6ZQK0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
Ncapd3Q6ZQK0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC43.78■■■■■ 4.6
Ncapd3Q6ZQK0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
Ncapd3Q6ZQK0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC43.72■■■■■ 4.59
Ncapd3Q6ZQK0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.59
Ncapd3Q6ZQK0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
Ncapd3Q6ZQK0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
Ncapd3Q6ZQK0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC43.63■■■■■ 4.58
Ncapd3Q6ZQK0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
Ncapd3Q6ZQK0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
Ncapd3Q6ZQK0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
Ncapd3Q6ZQK0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
Ncapd3Q6ZQK0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
Ncapd3Q6ZQK0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms