Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1X5

Abcc5, Multidrug resistance-associated protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc5Q9R1X5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC58.5■■■■■ 6.96
Abcc5Q9R1X5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC54.16■■■■■ 6.26
Abcc5Q9R1X5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.21■■■■■ 6.11
Abcc5Q9R1X5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC51.02■■■■■ 5.76
Abcc5Q9R1X5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC50.87■■■■■ 5.73
Abcc5Q9R1X5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC50.02■■■■■ 5.6
Abcc5Q9R1X5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.65■■■■■ 5.54
Abcc5Q9R1X5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.41■■■■■ 5.5
Abcc5Q9R1X5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.37■■■■■ 5.49
Abcc5Q9R1X5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC48.84■■■■■ 5.41
Abcc5Q9R1X5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.8■■■■■ 5.4
Abcc5Q9R1X5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC48.76■■■■■ 5.4
Abcc5Q9R1X5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.58■■■■■ 5.37
Abcc5Q9R1X5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48■■■■■ 5.28
Abcc5Q9R1X5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
Abcc5Q9R1X5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC47.32■■■■■ 5.17
Abcc5Q9R1X5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
Abcc5Q9R1X5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC47.05■■■■■ 5.12
Abcc5Q9R1X5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC47.02■■■■■ 5.12
Abcc5Q9R1X5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC46.96■■■■■ 5.11
Abcc5Q9R1X5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
Abcc5Q9R1X5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.75■■■■■ 5.07
Abcc5Q9R1X5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
Abcc5Q9R1X5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.06
Abcc5Q9R1X5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
Abcc5Q9R1X5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.02
Abcc5Q9R1X5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
Abcc5Q9R1X5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
Abcc5Q9R1X5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
Abcc5Q9R1X5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC46.23■■■■■ 4.99
Abcc5Q9R1X5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC46.11■■■■■ 4.97
Abcc5Q9R1X5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC46.07■■■■■ 4.97
Abcc5Q9R1X5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
Abcc5Q9R1X5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
Abcc5Q9R1X5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
Abcc5Q9R1X5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC45.62■■■■■ 4.89
Abcc5Q9R1X5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
Abcc5Q9R1X5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.31■■■■■ 4.84
Abcc5Q9R1X5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC45.09■■■■■ 4.81
Abcc5Q9R1X5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC44.99■■■■■ 4.79
Abcc5Q9R1X5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
Abcc5Q9R1X5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
Abcc5Q9R1X5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.74■■■■■ 4.75
Abcc5Q9R1X5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC44.73■■■■■ 4.75
Abcc5Q9R1X5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC44.71■■■■■ 4.75
Abcc5Q9R1X5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
Abcc5Q9R1X5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
Abcc5Q9R1X5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
Abcc5Q9R1X5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC44.35■■■■■ 4.69
Abcc5Q9R1X5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
Abcc5Q9R1X5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC44.23■■■■■ 4.67
Abcc5Q9R1X5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC44.16■■■■■ 4.66
Abcc5Q9R1X5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
Abcc5Q9R1X5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
Abcc5Q9R1X5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC44■■■■■ 4.63
Abcc5Q9R1X5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
Abcc5Q9R1X5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC43.93■■■■■ 4.62
Abcc5Q9R1X5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC43.92■■■■■ 4.62
Abcc5Q9R1X5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
Abcc5Q9R1X5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
Abcc5Q9R1X5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
Abcc5Q9R1X5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC43.59■■■■■ 4.57
Abcc5Q9R1X5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
Abcc5Q9R1X5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.53■■■■■ 4.56
Abcc5Q9R1X5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
Abcc5Q9R1X5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.51■■■■■ 4.56
Abcc5Q9R1X5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC43.5■■■■■ 4.55
Abcc5Q9R1X5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
Abcc5Q9R1X5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC43.43■■■■■ 4.54
Abcc5Q9R1X5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
Abcc5Q9R1X5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
Abcc5Q9R1X5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC43.37■■■■■ 4.53
Abcc5Q9R1X5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
Abcc5Q9R1X5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
Abcc5Q9R1X5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
Abcc5Q9R1X5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
Abcc5Q9R1X5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC43.09■■■■■ 4.49
Abcc5Q9R1X5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC43.08■■■■■ 4.49
Abcc5Q9R1X5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
Abcc5Q9R1X5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
Abcc5Q9R1X5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
Abcc5Q9R1X5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
Abcc5Q9R1X5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
Abcc5Q9R1X5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC42.96■■■■■ 4.47
Abcc5Q9R1X5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
Abcc5Q9R1X5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
Abcc5Q9R1X5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
Abcc5Q9R1X5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
Abcc5Q9R1X5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
Abcc5Q9R1X5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
Abcc5Q9R1X5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC42.77■■■■■ 4.44
Abcc5Q9R1X5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
Abcc5Q9R1X5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
Abcc5Q9R1X5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
Abcc5Q9R1X5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC42.58■■■■■ 4.41
Abcc5Q9R1X5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
Abcc5Q9R1X5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.55■■■■■ 4.4
Abcc5Q9R1X5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Abcc5Q9R1X5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Abcc5Q9R1X5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC42.47■■■■■ 4.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms