Protein–RNA interactions for Protein: Q80U22

Rusc2, Iporin, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rusc2Q80U22 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC66.09■■■■■ 8.17
Rusc2Q80U22 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC61.7■■■■■ 7.47
Rusc2Q80U22 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.37■■■■■ 7.26
Rusc2Q80U22 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC57.93■■■■■ 6.86
Rusc2Q80U22 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC56.82■■■■■ 6.69
Rusc2Q80U22 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC55.91■■■■■ 6.54
Rusc2Q80U22 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC55.6■■■■■ 6.49
Rusc2Q80U22 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC55.56■■■■■ 6.49
Rusc2Q80U22 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.56■■■■■ 6.49
Rusc2Q80U22 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.31■■■■■ 6.45
Rusc2Q80U22 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC54.99■■■■■ 6.39
Rusc2Q80U22 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC54.23■■■■■ 6.27
Rusc2Q80U22 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.81■■■■■ 6.2
Rusc2Q80U22 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC53.73■■■■■ 6.19
Rusc2Q80U22 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC53.67■■■■■ 6.18
Rusc2Q80U22 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.47■■■■■ 6.15
Rusc2Q80U22 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.91■■■■■ 6.06
Rusc2Q80U22 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.72■■■■■ 6.03
Rusc2Q80U22 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC52.51■■■■■ 6
Rusc2Q80U22 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.5■■■■■ 5.99
Rusc2Q80U22 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC52.46■■■■■ 5.99
Rusc2Q80U22 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC52.38■■■■■ 5.98
Rusc2Q80U22 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.54■■■■■ 5.84
Rusc2Q80U22 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC51.37■■■■■ 5.81
Rusc2Q80U22 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.11■■■■■ 5.77
Rusc2Q80U22 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.9■■■■■ 5.74
Rusc2Q80U22 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.78■■■■■ 5.72
Rusc2Q80U22 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC50.65■■■■■ 5.7
Rusc2Q80U22 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC50.62■■■■■ 5.69
Rusc2Q80U22 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.52■■■■■ 5.68
Rusc2Q80U22 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC50.51■■■■■ 5.68
Rusc2Q80U22 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.39■■■■■ 5.66
Rusc2Q80U22 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.24■■■■■ 5.63
Rusc2Q80U22 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC50.18■■■■■ 5.62
Rusc2Q80U22 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC50.02■■■■■ 5.6
Rusc2Q80U22 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC49.96■■■■■ 5.59
Rusc2Q80U22 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC49.9■■■■■ 5.58
Rusc2Q80U22 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.87■■■■■ 5.57
Rusc2Q80U22 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC49.85■■■■■ 5.57
Rusc2Q80U22 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.84■■■■■ 5.57
Rusc2Q80U22 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC49.81■■■■■ 5.56
Rusc2Q80U22 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.78■■■■■ 5.56
Rusc2Q80U22 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.7■■■■■ 5.55
Rusc2Q80U22 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.69■■■■■ 5.55
Rusc2Q80U22 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC49.55■■■■■ 5.52
Rusc2Q80U22 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC49.54■■■■■ 5.52
Rusc2Q80U22 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC49.44■■■■■ 5.5
Rusc2Q80U22 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC49.41■■■■■ 5.5
Rusc2Q80U22 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC49.34■■■■■ 5.49
Rusc2Q80U22 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.26■■■■■ 5.48
Rusc2Q80U22 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC49.25■■■■■ 5.48
Rusc2Q80U22 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.25■■■■■ 5.47
Rusc2Q80U22 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.18■■■■■ 5.46
Rusc2Q80U22 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC49.03■■■■■ 5.44
Rusc2Q80U22 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC48.99■■■■■ 5.43
Rusc2Q80U22 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC48.85■■■■■ 5.41
Rusc2Q80U22 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.72■■■■■ 5.39
Rusc2Q80U22 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC48.54■■■■■ 5.36
Rusc2Q80U22 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC48.52■■■■■ 5.36
Rusc2Q80U22 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC48.42■■■■■ 5.34
Rusc2Q80U22 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.42■■■■■ 5.34
Rusc2Q80U22 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.29■■■■■ 5.32
Rusc2Q80U22 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.24■■■■■ 5.31
Rusc2Q80U22 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
Rusc2Q80U22 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC48.01■■■■■ 5.28
Rusc2Q80U22 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC48■■■■■ 5.27
Rusc2Q80U22 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.97■■■■■ 5.27
Rusc2Q80U22 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.96■■■■■ 5.27
Rusc2Q80U22 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC47.9■■■■■ 5.26
Rusc2Q80U22 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.9■■■■■ 5.26
Rusc2Q80U22 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
Rusc2Q80U22 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC47.84■■■■■ 5.25
Rusc2Q80U22 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC47.7■■■■■ 5.23
Rusc2Q80U22 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
Rusc2Q80U22 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.66■■■■■ 5.22
Rusc2Q80U22 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
Rusc2Q80U22 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
Rusc2Q80U22 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC47.39■■■■■ 5.18
Rusc2Q80U22 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
Rusc2Q80U22 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.17■■■■■ 5.14
Rusc2Q80U22 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC47.13■■■■■ 5.14
Rusc2Q80U22 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC47.12■■■■■ 5.13
Rusc2Q80U22 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.11■■■■■ 5.13
Rusc2Q80U22 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
Rusc2Q80U22 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC47.06■■■■■ 5.12
Rusc2Q80U22 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.06■■■■■ 5.12
Rusc2Q80U22 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.06■■■■■ 5.12
Rusc2Q80U22 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.05■■■■■ 5.12
Rusc2Q80U22 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC47.03■■■■■ 5.12
Rusc2Q80U22 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
Rusc2Q80U22 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC47.02■■■■■ 5.12
Rusc2Q80U22 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC47■■■■■ 5.12
Rusc2Q80U22 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.12
Rusc2Q80U22 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC47■■■■■ 5.11
Rusc2Q80U22 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC46.98■■■■■ 5.11
Rusc2Q80U22 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
Rusc2Q80U22 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.87■■■■■ 5.09
Rusc2Q80U22 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.84■■■■■ 5.09
Rusc2Q80U22 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC46.82■■■■■ 5.09
Rusc2Q80U22 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms