Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYD6

Lmtk2, Serine/threonine-protein kinase LMTK2, mousemouse

Predictions only

Length 1,471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmtk2Q3TYD6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC59.36■■■■■ 7.09
Lmtk2Q3TYD6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC54.95■■■■■ 6.39
Lmtk2Q3TYD6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.91■■■■■ 6.22
Lmtk2Q3TYD6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC51.88■■■■■ 5.9
Lmtk2Q3TYD6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC51.67■■■■■ 5.86
Lmtk2Q3TYD6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC50.92■■■■■ 5.74
Lmtk2Q3TYD6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.57■■■■■ 5.69
Lmtk2Q3TYD6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.14■■■■■ 5.62
Lmtk2Q3TYD6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.1■■■■■ 5.61
Lmtk2Q3TYD6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.67■■■■■ 5.54
Lmtk2Q3TYD6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC49.49■■■■■ 5.51
Lmtk2Q3TYD6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC49.47■■■■■ 5.51
Lmtk2Q3TYD6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.31■■■■■ 5.48
Lmtk2Q3TYD6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.89■■■■■ 5.42
Lmtk2Q3TYD6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.29■■■■■ 5.32
Lmtk2Q3TYD6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.93■■■■■ 5.26
Lmtk2Q3TYD6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC47.92■■■■■ 5.26
Lmtk2Q3TYD6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC47.8■■■■■ 5.24
Lmtk2Q3TYD6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
Lmtk2Q3TYD6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC47.71■■■■■ 5.23
Lmtk2Q3TYD6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC47.7■■■■■ 5.23
Lmtk2Q3TYD6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
Lmtk2Q3TYD6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.35■■■■■ 5.17
Lmtk2Q3TYD6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
Lmtk2Q3TYD6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
Lmtk2Q3TYD6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
Lmtk2Q3TYD6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.13
Lmtk2Q3TYD6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
Lmtk2Q3TYD6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
Lmtk2Q3TYD6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC46.99■■■■■ 5.11
Lmtk2Q3TYD6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
Lmtk2Q3TYD6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC46.87■■■■■ 5.09
Lmtk2Q3TYD6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC46.71■■■■■ 5.07
Lmtk2Q3TYD6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.05
Lmtk2Q3TYD6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
Lmtk2Q3TYD6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC46.48■■■■■ 5.03
Lmtk2Q3TYD6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.01
Lmtk2Q3TYD6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.04■■■■■ 4.96
Lmtk2Q3TYD6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC45.93■■■■■ 4.94
Lmtk2Q3TYD6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC45.68■■■■■ 4.9
Lmtk2Q3TYD6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
Lmtk2Q3TYD6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
Lmtk2Q3TYD6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC45.46■■■■■ 4.87
Lmtk2Q3TYD6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC45.41■■■■■ 4.86
Lmtk2Q3TYD6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.4■■■■■ 4.86
Lmtk2Q3TYD6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.85
Lmtk2Q3TYD6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
Lmtk2Q3TYD6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
Lmtk2Q3TYD6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC45.09■■■■■ 4.81
Lmtk2Q3TYD6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
Lmtk2Q3TYD6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC44.98■■■■■ 4.79
Lmtk2Q3TYD6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
Lmtk2Q3TYD6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
Lmtk2Q3TYD6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC44.75■■■■■ 4.76
Lmtk2Q3TYD6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC44.71■■■■■ 4.75
Lmtk2Q3TYD6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
Lmtk2Q3TYD6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC44.64■■■■■ 4.74
Lmtk2Q3TYD6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC44.63■■■■■ 4.73
Lmtk2Q3TYD6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
Lmtk2Q3TYD6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC44.41■■■■■ 4.7
Lmtk2Q3TYD6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
Lmtk2Q3TYD6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
Lmtk2Q3TYD6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
Lmtk2Q3TYD6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.25■■■■■ 4.67
Lmtk2Q3TYD6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC44.22■■■■■ 4.67
Lmtk2Q3TYD6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC44.21■■■■■ 4.67
Lmtk2Q3TYD6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
Lmtk2Q3TYD6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.13■■■■■ 4.65
Lmtk2Q3TYD6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC44.12■■■■■ 4.65
Lmtk2Q3TYD6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
Lmtk2Q3TYD6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
Lmtk2Q3TYD6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC44.04■■■■■ 4.64
Lmtk2Q3TYD6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
Lmtk2Q3TYD6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
Lmtk2Q3TYD6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC43.95■■■■■ 4.63
Lmtk2Q3TYD6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
Lmtk2Q3TYD6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC43.8■■■■■ 4.6
Lmtk2Q3TYD6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
Lmtk2Q3TYD6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
Lmtk2Q3TYD6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
Lmtk2Q3TYD6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
Lmtk2Q3TYD6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
Lmtk2Q3TYD6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC43.64■■■■■ 4.58
Lmtk2Q3TYD6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC43.6■■■■■ 4.57
Lmtk2Q3TYD6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
Lmtk2Q3TYD6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC43.56■■■■■ 4.56
Lmtk2Q3TYD6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
Lmtk2Q3TYD6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
Lmtk2Q3TYD6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC43.51■■■■■ 4.56
Lmtk2Q3TYD6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
Lmtk2Q3TYD6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
Lmtk2Q3TYD6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC43.43■■■■■ 4.54
Lmtk2Q3TYD6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
Lmtk2Q3TYD6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Lmtk2Q3TYD6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC43.33■■■■■ 4.53
Lmtk2Q3TYD6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
Lmtk2Q3TYD6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC43.29■■■■■ 4.52
Lmtk2Q3TYD6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
Lmtk2Q3TYD6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
Lmtk2Q3TYD6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC43.17■■■■■ 4.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms