Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC65.25■■■■■ 8.04
Pbrm1Q8BSQ9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC60.85■■■■■ 7.33
Pbrm1Q8BSQ9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.51■■■■■ 7.12
Pbrm1Q8BSQ9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC57.11■■■■■ 6.73
Pbrm1Q8BSQ9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC56.41■■■■■ 6.62
Pbrm1Q8BSQ9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC55.26■■■■■ 6.44
Pbrm1Q8BSQ9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC55.21■■■■■ 6.43
Pbrm1Q8BSQ9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC54.88■■■■■ 6.38
Pbrm1Q8BSQ9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.84■■■■■ 6.37
Pbrm1Q8BSQ9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.66■■■■■ 6.34
Pbrm1Q8BSQ9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC54.37■■■■■ 6.29
Pbrm1Q8BSQ9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC53.31■■■■■ 6.12
Pbrm1Q8BSQ9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC52.77■■■■■ 6.04
Pbrm1Q8BSQ9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.77■■■■■ 6.04
Pbrm1Q8BSQ9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC52.76■■■■■ 6.04
Pbrm1Q8BSQ9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.43■■■■■ 5.98
Pbrm1Q8BSQ9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.37■■■■■ 5.97
Pbrm1Q8BSQ9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.99■■■■■ 5.91
Pbrm1Q8BSQ9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC51.87■■■■■ 5.89
Pbrm1Q8BSQ9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.84■■■■■ 5.89
Pbrm1Q8BSQ9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC51.78■■■■■ 5.88
Pbrm1Q8BSQ9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC51.67■■■■■ 5.86
Pbrm1Q8BSQ9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.45■■■■■ 5.83
Pbrm1Q8BSQ9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51■■■■■ 5.75
Pbrm1Q8BSQ9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.88■■■■■ 5.74
Pbrm1Q8BSQ9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.83■■■■■ 5.73
Pbrm1Q8BSQ9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC50.65■■■■■ 5.7
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.34■■■■■ 5.65
Pbrm1Q8BSQ9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.34■■■■■ 5.65
Pbrm1Q8BSQ9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.16■■■■■ 5.62
Pbrm1Q8BSQ9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC50.16■■■■■ 5.62
Pbrm1Q8BSQ9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC50.03■■■■■ 5.6
Pbrm1Q8BSQ9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC50■■■■■ 5.6
Pbrm1Q8BSQ9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.88■■■■■ 5.58
Pbrm1Q8BSQ9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.83■■■■■ 5.57
Pbrm1Q8BSQ9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC49.74■■■■■ 5.55
Pbrm1Q8BSQ9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.71■■■■■ 5.55
Pbrm1Q8BSQ9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.65■■■■■ 5.54
Pbrm1Q8BSQ9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC49.6■■■■■ 5.53
Pbrm1Q8BSQ9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.41■■■■■ 5.5
Pbrm1Q8BSQ9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC49.35■■■■■ 5.49
Pbrm1Q8BSQ9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC49.33■■■■■ 5.49
Pbrm1Q8BSQ9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC49.22■■■■■ 5.47
Pbrm1Q8BSQ9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC49.17■■■■■ 5.46
Pbrm1Q8BSQ9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.13■■■■■ 5.46
Pbrm1Q8BSQ9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.94■■■■■ 5.42
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC48.86■■■■■ 5.41
Pbrm1Q8BSQ9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC48.83■■■■■ 5.41
Pbrm1Q8BSQ9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC48.77■■■■■ 5.4
Pbrm1Q8BSQ9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC48.69■■■■■ 5.38
Pbrm1Q8BSQ9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC48.66■■■■■ 5.38
Pbrm1Q8BSQ9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.62■■■■■ 5.37
Pbrm1Q8BSQ9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.56■■■■■ 5.36
Pbrm1Q8BSQ9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC48.5■■■■■ 5.35
Pbrm1Q8BSQ9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC48.45■■■■■ 5.35
Pbrm1Q8BSQ9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC48.44■■■■■ 5.35
Pbrm1Q8BSQ9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.44■■■■■ 5.35
Pbrm1Q8BSQ9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.32■■■■■ 5.33
Pbrm1Q8BSQ9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC48.29■■■■■ 5.32
Pbrm1Q8BSQ9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC48.18■■■■■ 5.3
Pbrm1Q8BSQ9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.12■■■■■ 5.29
Pbrm1Q8BSQ9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.01■■■■■ 5.28
Pbrm1Q8BSQ9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC47.95■■■■■ 5.27
Pbrm1Q8BSQ9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC47.89■■■■■ 5.26
Pbrm1Q8BSQ9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC47.85■■■■■ 5.25
Pbrm1Q8BSQ9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
Pbrm1Q8BSQ9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC47.57■■■■■ 5.21
Pbrm1Q8BSQ9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC47.56■■■■■ 5.2
Pbrm1Q8BSQ9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
Pbrm1Q8BSQ9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC47.54■■■■■ 5.2
Pbrm1Q8BSQ9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC47.45■■■■■ 5.19
Pbrm1Q8BSQ9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
Pbrm1Q8BSQ9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC47.38■■■■■ 5.18
Pbrm1Q8BSQ9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
Pbrm1Q8BSQ9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
Pbrm1Q8BSQ9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
Pbrm1Q8BSQ9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.15■■■■■ 5.14
Pbrm1Q8BSQ9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.14
Pbrm1Q8BSQ9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC47.07■■■■■ 5.13
Pbrm1Q8BSQ9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
Pbrm1Q8BSQ9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC46.96■■■■■ 5.11
Pbrm1Q8BSQ9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.88■■■■■ 5.1
Pbrm1Q8BSQ9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC46.87■■■■■ 5.09
Pbrm1Q8BSQ9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC46.84■■■■■ 5.09
Pbrm1Q8BSQ9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC46.81■■■■■ 5.08
Pbrm1Q8BSQ9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC46.74■■■■■ 5.07
Pbrm1Q8BSQ9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC46.7■■■■■ 5.07
Pbrm1Q8BSQ9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.68■■■■■ 5.06
Pbrm1Q8BSQ9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
Pbrm1Q8BSQ9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC46.61■■■■■ 5.05
Pbrm1Q8BSQ9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.61■■■■■ 5.05
Pbrm1Q8BSQ9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
Pbrm1Q8BSQ9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.54■■■■■ 5.04
Pbrm1Q8BSQ9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
Pbrm1Q8BSQ9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
Pbrm1Q8BSQ9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC46.43■■■■■ 5.02
Pbrm1Q8BSQ9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
Pbrm1Q8BSQ9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5
Pbrm1Q8BSQ9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC46.27■■■■■ 5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms