RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000022469.12

Nisch-201, Transcript of Nischarin, mousemouse

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene Nisch, Length 5,559 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nisch-201ENSMUST00000022469 Golga3P55937 1487 aa28.32■■■□□ 2.12
Nisch-201ENSMUST00000022469 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
Nisch-201ENSMUST00000022469 Baz1aO88379 1555 aa28.28■■■□□ 2.12
Nisch-201ENSMUST00000022469 NacadQ5SWP3 1504 aa28.16■■■□□ 2.1
Nisch-201ENSMUST00000022469 Clstn2Q9ER65 966 aa28.16■■■□□ 2.1
Nisch-201ENSMUST00000022469 Ubl4bQ9CQ84 188 aa28.11■■■□□ 2.09
Nisch-201ENSMUST00000022469 CanxP35564 591 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
Nisch-201ENSMUST00000022469 Ofd1Q80Z25 1017 aa28.09■■■□□ 2.09
Nisch-201ENSMUST00000022469 Eea1Q8BL66 1411 aa28.06■■■□□ 2.08
Nisch-201ENSMUST00000022469 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm13695A2AK44 830 aa28.04■■■□□ 2.08
Nisch-201ENSMUST00000022469 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.08
Nisch-201ENSMUST00000022469 Rgl3Q3UYI5 709 aa28.01■■■□□ 2.07
Nisch-201ENSMUST00000022469 P3h3Q8CG70 732 aa28■■■□□ 2.07
Nisch-201ENSMUST00000022469 Ccdc27Q3V036 639 aa27.99■■■□□ 2.07
Nisch-201ENSMUST00000022469 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
Nisch-201ENSMUST00000022469 DekQ7TNV0 380 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
Nisch-201ENSMUST00000022469 Trim30dE9PWL0 497 aa27.94■■■□□ 2.06
Nisch-201ENSMUST00000022469 Trim44Q9QXA7 346 aa27.88■■■□□ 2.05
Nisch-201ENSMUST00000022469 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
Nisch-201ENSMUST00000022469 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
Nisch-201ENSMUST00000022469 Vsig10D3YX43 558 aa27.79■■■□□ 2.04
Nisch-201ENSMUST00000022469 Card11Q8CIS0 1159 aa27.78■■■□□ 2.04
Nisch-201ENSMUST00000022469 Kif15Q6P9L6 1387 aa27.78■■■□□ 2.04
Nisch-201ENSMUST00000022469 Trim26Q99PN3 545 aa27.78■■■□□ 2.04
Nisch-201ENSMUST00000022469 Mia2Q91ZV0 1396 aa27.77■■■□□ 2.04
Nisch-201ENSMUST00000022469 Htatsf1Q8BGC0 757 aa27.77■■■□□ 2.04
Nisch-201ENSMUST00000022469 Fgd1P52734 960 aa27.76■■■□□ 2.03
Nisch-201ENSMUST00000022469 CatipB9EKE5 520 aa27.74■■■□□ 2.03
Nisch-201ENSMUST00000022469 Ppm1gQ61074 542 aa27.73■■■□□ 2.03
Nisch-201ENSMUST00000022469 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
Nisch-201ENSMUST00000022469 Bcl11aQ9QYE3 773 aa27.71■■■□□ 2.03
Nisch-201ENSMUST00000022469 Ccdc18Q640L5 1455 aa27.67■■■□□ 2.02
Nisch-201ENSMUST00000022469 Lmod3E9QA62 571 aa27.65■■■□□ 2.02
Nisch-201ENSMUST00000022469 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
Nisch-201ENSMUST00000022469 Apbb1Q9QXJ1 710 aa27.62■■■□□ 2.01
Nisch-201ENSMUST00000022469 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
Nisch-201ENSMUST00000022469 Plcb2A3KGF7 1181 aa27.57■■■□□ 2
Nisch-201ENSMUST00000022469 PtmaP26350 111 aa27.57■■■□□ 2
Nisch-201ENSMUST00000022469 Mtus2Q3UHD3 1353 aa27.54■■■□□ 2
Nisch-201ENSMUST00000022469 Kdm2aP59997 1161 aa27.53■■■□□ 2
Nisch-201ENSMUST00000022469 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
Nisch-201ENSMUST00000022469 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa27.53■■■□□ 2
Nisch-201ENSMUST00000022469 Neurod2Q62414 383 aa27.52■■■□□ 2
Nisch-201ENSMUST00000022469 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa27.52■■■□□ 2
Nisch-201ENSMUST00000022469 Irx3P81067 507 aa27.52■■■□□ 2
Nisch-201ENSMUST00000022469 Kdm5dQ62240 1548 aa27.51■■□□□ 1.99
Nisch-201ENSMUST00000022469 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
Nisch-201ENSMUST00000022469 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
Nisch-201ENSMUST00000022469 Cep162Q6ZQ06 1403 aa27.5■■□□□ 1.99
Nisch-201ENSMUST00000022469 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa27.5■■□□□ 1.99
Nisch-201ENSMUST00000022469 Dbr1Q923B1 550 aa27.49■■□□□ 1.99
Nisch-201ENSMUST00000022469 IqubQ8CDK3 788 aa27.47■■□□□ 1.99
Nisch-201ENSMUST00000022469 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
Nisch-201ENSMUST00000022469 B4galnt3Q6L8S8 986 aa27.44■■□□□ 1.98
Nisch-201ENSMUST00000022469 Slc4a3P16283 1227 aa27.43■■□□□ 1.98
Nisch-201ENSMUST00000022469 Map7O88735 730 aa27.42■■□□□ 1.98
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm20521D3Z5F7 333 aa27.42■■□□□ 1.98
Nisch-201ENSMUST00000022469 Ercc6F8VPZ5 1481 aa27.4■■□□□ 1.98
Nisch-201ENSMUST00000022469 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa27.4■■□□□ 1.98
Nisch-201ENSMUST00000022469 Supt16hQ920B9 1047 aa27.39■■□□□ 1.98
Nisch-201ENSMUST00000022469 Arhgap27A2AB59 869 aa27.36■■□□□ 1.97
Nisch-201ENSMUST00000022469 Rwdd1Q9CQK7 243 aa27.36■■□□□ 1.97
Nisch-201ENSMUST00000022469 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
Nisch-201ENSMUST00000022469 Fmn1Q05860 1466 aa27.35■■□□□ 1.97
Nisch-201ENSMUST00000022469 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
Nisch-201ENSMUST00000022469 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
Nisch-201ENSMUST00000022469 Exoc6Q8R313 802 aa27.31■■□□□ 1.96
Nisch-201ENSMUST00000022469 Armcx1Q9CX83 456 aa27.28■■□□□ 1.96
Nisch-201ENSMUST00000022469 Plppr3Q7TPB0 716 aa27.28■■□□□ 1.96
Nisch-201ENSMUST00000022469 Pkd2O35245 966 aa27.28■■□□□ 1.96
Nisch-201ENSMUST00000022469 Ipo9Q91YE6 1041 aa27.27■■□□□ 1.96
Nisch-201ENSMUST00000022469 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
Nisch-201ENSMUST00000022469 Spryd3E9Q9B3 442 aa27.25■■□□□ 1.95
Nisch-201ENSMUST00000022469 NudcO35685 332 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
Nisch-201ENSMUST00000022469 Rundc1Q0VDN7 615 aa27.24■■□□□ 1.95
Nisch-201ENSMUST00000022469 Baz1bQ9Z277 1479 aa27.24■■□□□ 1.95
Nisch-201ENSMUST00000022469 AU015836B2RUM3 263 aa27.23■■□□□ 1.95
Nisch-201ENSMUST00000022469 Dnai1Q8C0M8 701 aa27.22■■□□□ 1.95
Nisch-201ENSMUST00000022469 Chmp5Q9D7S9 219 aa27.22■■□□□ 1.95
Nisch-201ENSMUST00000022469 Fyco1Q8VDC1 1437 aa27.22■■□□□ 1.95
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm6268A2A3U9 297 aa27.21■■□□□ 1.95
Nisch-201ENSMUST00000022469 Arhgap35Q91YM2 1499 aa27.21■■□□□ 1.95
Nisch-201ENSMUST00000022469 KnstrnQ9D9Z1 312 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
Nisch-201ENSMUST00000022469 EspnQ9ET47 871 aa27.18■■□□□ 1.94
Nisch-201ENSMUST00000022469 Fhad1A6PWD2 1420 aa27.16■■□□□ 1.94
Nisch-201ENSMUST00000022469 Kif27Q7M6Z4 1394 aa27.16■■□□□ 1.94
Nisch-201ENSMUST00000022469 Stag3O70576 1240 aa27.15■■□□□ 1.94
Nisch-201ENSMUST00000022469 Zscan21Q07231 555 aa27.15■■□□□ 1.94
Nisch-201ENSMUST00000022469 Irx6Q9ER75 438 aa27.14■■□□□ 1.94
Nisch-201ENSMUST00000022469 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
Nisch-201ENSMUST00000022469 Casc1Q6TDU8 730 aa27.13■■□□□ 1.93
Nisch-201ENSMUST00000022469 Dnttip2Q8R2M2 758 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
Nisch-201ENSMUST00000022469 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
Nisch-201ENSMUST00000022469 Stk24Q99KH8 431 aa27.11■■□□□ 1.93
Nisch-201ENSMUST00000022469 Mphosph9A6H5Y1 991 aa27.1■■□□□ 1.93
Nisch-201ENSMUST00000022469 Map4P27546 1125 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
Nisch-201ENSMUST00000022469 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa27.09■■□□□ 1.93
Nisch-201ENSMUST00000022469 Iqcf3Q9D498 203 aa27.08■■□□□ 1.93
Nisch-201ENSMUST00000022469 Aebp1Q640N1 1128 aa27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.4 ms