RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454619.5

NME4-208, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 719 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-208ENST00000454619 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.18■■■■□ 3.38
NME4-208ENST00000454619 ABCC9O60706 1549 aa32.8■■■□□ 2.84
NME4-208ENST00000454619 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.62■■■□□ 2.81
NME4-208ENST00000454619 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.17■■■□□ 2.58
NME4-208ENST00000454619 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.93■■■□□ 2.54
NME4-208ENST00000454619 NACADO15069 1562 aa30.88■■■□□ 2.53
NME4-208ENST00000454619 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.59■■■□□ 2.49
NME4-208ENST00000454619 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.46■■■□□ 2.47
NME4-208ENST00000454619 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.42■■■□□ 2.46
NME4-208ENST00000454619 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.4■■■□□ 2.46
NME4-208ENST00000454619 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.22■■■□□ 2.43
NME4-208ENST00000454619 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
NME4-208ENST00000454619 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
NME4-208ENST00000454619 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.91■■■□□ 2.38
NME4-208ENST00000454619 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.88■■■□□ 2.37
NME4-208ENST00000454619 SCRIBQ14160 1630 aa29.67■■■□□ 2.34
NME4-208ENST00000454619 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.63■■■□□ 2.33
NME4-208ENST00000454619 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.6■■■□□ 2.33
NME4-208ENST00000454619 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
NME4-208ENST00000454619 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.96■■■□□ 2.23
NME4-208ENST00000454619 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.64■■■□□ 2.18
NME4-208ENST00000454619 NCAPD3P42695 1498 aa28.49■■■□□ 2.15
NME4-208ENST00000454619 CUX2O14529 1486 aa28.44■■■□□ 2.14
NME4-208ENST00000454619 ERCC6Q03468 1493 aa28.38■■■□□ 2.13
NME4-208ENST00000454619 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.36■■■□□ 2.13
NME4-208ENST00000454619 SMARCA2P51531 1590 aa28.31■■■□□ 2.12
NME4-208ENST00000454619 HMGXB3Q12766 1538 aa28.29■■■□□ 2.12
NME4-208ENST00000454619 SMARCA4P51532 1647 aa28.29■■■□□ 2.12
NME4-208ENST00000454619 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
NME4-208ENST00000454619 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
NME4-208ENST00000454619 NESP48681 1621 aa28.09■■■□□ 2.09
NME4-208ENST00000454619 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.03■■■□□ 2.08
NME4-208ENST00000454619 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.92■■■□□ 2.06
NME4-208ENST00000454619 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
NME4-208ENST00000454619 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.85■■■□□ 2.05
NME4-208ENST00000454619 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.76■■■□□ 2.04
NME4-208ENST00000454619 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.75■■■□□ 2.03
NME4-208ENST00000454619 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.61■■■□□ 2.01
NME4-208ENST00000454619 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.53■■■□□ 2
NME4-208ENST00000454619 WIZO95785 1651 aa27.5■■□□□ 1.99
NME4-208ENST00000454619 WDR62O43379 1518 aa27.48■■□□□ 1.99
NME4-208ENST00000454619 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.38■■□□□ 1.97
NME4-208ENST00000454619 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.31■■□□□ 1.96
NME4-208ENST00000454619 TRIM41Q8WV44 630 aa27.27■■□□□ 1.96
NME4-208ENST00000454619 CFTRP13569 1480 aa27.25■■□□□ 1.95
NME4-208ENST00000454619 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
NME4-208ENST00000454619 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
NME4-208ENST00000454619 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
NME4-208ENST00000454619 OSCARQ8IYS5 282 aa27.05■■□□□ 1.92
NME4-208ENST00000454619 PRDM2Q13029 1718 aa26.99■■□□□ 1.91
NME4-208ENST00000454619 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.84■■□□□ 1.89
NME4-208ENST00000454619 IFT140Q96RY7 1462 aa26.84■■□□□ 1.89
NME4-208ENST00000454619 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
NME4-208ENST00000454619 TOPBP1Q92547 1522 aa26.75■■□□□ 1.87
NME4-208ENST00000454619 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.74■■□□□ 1.87
NME4-208ENST00000454619 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.74■■□□□ 1.87
NME4-208ENST00000454619 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.74■■□□□ 1.87
NME4-208ENST00000454619 ABCC8Q09428 1581 aa26.71■■□□□ 1.87
NME4-208ENST00000454619 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.66■■□□□ 1.86
NME4-208ENST00000454619 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
NME4-208ENST00000454619 ARHGEF11O15085 1522 aa26.63■■□□□ 1.85
NME4-208ENST00000454619 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
NME4-208ENST00000454619 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.5■■□□□ 1.832e-8■■■■■ 32.9
NME4-208ENST00000454619 CHD1O14646 1710 aa26.49■■□□□ 1.83
NME4-208ENST00000454619 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
NME4-208ENST00000454619 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.4■■□□□ 1.82
NME4-208ENST00000454619 FBLN2P98095 1184 aa26.38■■□□□ 1.81
NME4-208ENST00000454619 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.35■■□□□ 1.81
NME4-208ENST00000454619 ARAP1Q96P48 1450 aa26.34■■□□□ 1.81
NME4-208ENST00000454619 SOGA1O94964 1423 aa26.33■■□□□ 1.81
NME4-208ENST00000454619 WDR97A6NE52 1622 aa26.32■■□□□ 1.8
NME4-208ENST00000454619 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
NME4-208ENST00000454619 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.26■■□□□ 1.79
NME4-208ENST00000454619 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.25■■□□□ 1.79
NME4-208ENST00000454619 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
NME4-208ENST00000454619 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
NME4-208ENST00000454619 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.19■■□□□ 1.78
NME4-208ENST00000454619 CUX1P39880 1505 aa26.19■■□□□ 1.78
NME4-208ENST00000454619 SYNJ1O43426 1573 aa26.18■■□□□ 1.78
NME4-208ENST00000454619 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
NME4-208ENST00000454619 GRIN2BQ13224 1484 aa26.16■■□□□ 1.78
NME4-208ENST00000454619 SYNJ2O15056 1496 aa26.11■■□□□ 1.77
NME4-208ENST00000454619 PBRM1Q86U86 1689 aa26.04■■□□□ 1.76
NME4-208ENST00000454619 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.02■■□□□ 1.76
NME4-208ENST00000454619 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.97■■□□□ 1.75
NME4-208ENST00000454619 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.96■■□□□ 1.75
NME4-208ENST00000454619 GRIN2AQ12879 1464 aa25.82■■□□□ 1.72
NME4-208ENST00000454619 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.81■■□□□ 1.722e-6■■■□□ 15
NME4-208ENST00000454619 ADAMTS12P58397 1594 aa25.78■■□□□ 1.72
NME4-208ENST00000454619 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
NME4-208ENST00000454619 NUP160Q12769 1436 aa25.74■■□□□ 1.71
NME4-208ENST00000454619 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.74■■□□□ 1.71
NME4-208ENST00000454619 TOP2BQ02880 1626 aa25.73■■□□□ 1.71
NME4-208ENST00000454619 CEP170Q5SW79 1584 aa25.73■■□□□ 1.71
NME4-208ENST00000454619 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.73■■□□□ 1.71
NME4-208ENST00000454619 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.69■■□□□ 1.7
NME4-208ENST00000454619 SHROOM2Q13796 1616 aa25.66■■□□□ 1.7
NME4-208ENST00000454619 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.65■■□□□ 1.7
NME4-208ENST00000454619 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
NME4-208ENST00000454619 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
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