RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433358.5

NME4-204, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 3

Gene NME4, Length 966 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-204ENST00000433358 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.6■■■■■ 6.81
NME4-204ENST00000433358 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.34■■■■■ 5.81
NME4-204ENST00000433358 ABCC9O60706 1549 aa51.05■■■■■ 5.76
NME4-204ENST00000433358 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.73■■■■■ 5.39
NME4-204ENST00000433358 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.56■■■■■ 5.36
NME4-204ENST00000433358 NACADO15069 1562 aa48.52■■■■■ 5.36
NME4-204ENST00000433358 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.02■■■■■ 5.28
NME4-204ENST00000433358 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.8■■■■■ 5.24
NME4-204ENST00000433358 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.7■■■■■ 5.231e-8■■□□□ 14.2
NME4-204ENST00000433358 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.6■■■■■ 5.21
NME4-204ENST00000433358 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.58■■■■■ 5.21
NME4-204ENST00000433358 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.51■■■■■ 5.2
NME4-204ENST00000433358 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.31■■■■■ 5.16
NME4-204ENST00000433358 SCRIBQ14160 1630 aa46.87■■■■■ 5.09
NME4-204ENST00000433358 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.68■■■■■ 5.06
NME4-204ENST00000433358 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.1■■■■■ 4.97
NME4-204ENST00000433358 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.08■■■■■ 4.97
NME4-204ENST00000433358 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.93■■■■■ 4.94
NME4-204ENST00000433358 NCAPD3P42695 1498 aa44.86■■■■■ 4.77
NME4-204ENST00000433358 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.78■■■■■ 4.76
NME4-204ENST00000433358 SMARCA4P51532 1647 aa44.76■■■■■ 4.76
NME4-204ENST00000433358 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.65■■■■■ 4.74
NME4-204ENST00000433358 SMARCA2P51531 1590 aa44.61■■■■■ 4.73
NME4-204ENST00000433358 HMGXB3Q12766 1538 aa44.47■■■■■ 4.71
NME4-204ENST00000433358 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.39■■■■■ 4.7
NME4-204ENST00000433358 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.34■■■■■ 4.69
NME4-204ENST00000433358 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.33■■■■■ 4.69
NME4-204ENST00000433358 ERCC6Q03468 1493 aa44.01■■■■■ 4.64
NME4-204ENST00000433358 NESP48681 1621 aa43.99■■■■■ 4.63
NME4-204ENST00000433358 WIZO95785 1651 aa43.84■■■■■ 4.61
NME4-204ENST00000433358 CUX2O14529 1486 aa43.76■■■■■ 4.6
NME4-204ENST00000433358 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.69■■■■■ 4.58
NME4-204ENST00000433358 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.69■■■■■ 4.58
NME4-204ENST00000433358 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.54■■■■■ 4.56
NME4-204ENST00000433358 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.5■■■■■ 4.55
NME4-204ENST00000433358 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.34■■■■■ 4.53
NME4-204ENST00000433358 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.34■■■■■ 4.53
NME4-204ENST00000433358 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.32■■■■■ 4.52
NME4-204ENST00000433358 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.3■■■■■ 4.52
NME4-204ENST00000433358 CFTRP13569 1480 aa43.11■■■■■ 4.49
NME4-204ENST00000433358 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.05■■■■■ 4.48
NME4-204ENST00000433358 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43■■■■■ 4.47
NME4-204ENST00000433358 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.97■■■■■ 4.47
NME4-204ENST00000433358 WDR62O43379 1518 aa42.91■■■■■ 4.46
NME4-204ENST00000433358 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.9■■■■■ 4.46
NME4-204ENST00000433358 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.61■■■■■ 4.41
NME4-204ENST00000433358 PRDM2Q13029 1718 aa42.49■■■■■ 4.39
NME4-204ENST00000433358 TOPBP1Q92547 1522 aa42.22■■■■■ 4.35
NME4-204ENST00000433358 ABCC8Q09428 1581 aa42.18■■■■■ 4.34
NME4-204ENST00000433358 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.17■■■■■ 4.34
NME4-204ENST00000433358 IFT140Q96RY7 1462 aa42.12■■■■■ 4.33
NME4-204ENST00000433358 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.06■■■■■ 4.32
NME4-204ENST00000433358 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.02■■■■■ 4.32
NME4-204ENST00000433358 OSCARQ8IYS5 282 aa41.97■■■■■ 4.31
NME4-204ENST00000433358 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.83■■■■■ 4.29
NME4-204ENST00000433358 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.78■■■■■ 4.28
NME4-204ENST00000433358 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.74■■■■■ 4.272e-7■■■■■ 32.9
NME4-204ENST00000433358 SOGA1O94964 1423 aa41.71■■■■■ 4.27
NME4-204ENST00000433358 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.71■■■■■ 4.27
NME4-204ENST00000433358 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.71■■■■■ 4.27
NME4-204ENST00000433358 CUX1P39880 1505 aa41.66■■■■■ 4.26
NME4-204ENST00000433358 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.63■■■■■ 4.25
NME4-204ENST00000433358 TRIM41Q8WV44 630 aa41.62■■■■■ 4.25
NME4-204ENST00000433358 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
NME4-204ENST00000433358 FBLN2P98095 1184 aa41.41■■■■■ 4.22
NME4-204ENST00000433358 WDR97A6NE52 1622 aa41.34■■■■■ 4.21
NME4-204ENST00000433358 CHD1O14646 1710 aa41.27■■■■■ 4.2
NME4-204ENST00000433358 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.27■■■■■ 4.2
NME4-204ENST00000433358 GRIN2BQ13224 1484 aa41.24■■■■■ 4.19
NME4-204ENST00000433358 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.22■■■■■ 4.19
NME4-204ENST00000433358 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.22■■■■■ 4.19
NME4-204ENST00000433358 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.22■■■■■ 4.19
NME4-204ENST00000433358 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.18■■■■■ 4.18
NME4-204ENST00000433358 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.18■■■■■ 4.18
NME4-204ENST00000433358 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.18■■■■■ 4.182e-6■■■□□ 15
NME4-204ENST00000433358 ARHGEF11O15085 1522 aa41.17■■■■■ 4.18
NME4-204ENST00000433358 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.16■■■■■ 4.18
NME4-204ENST00000433358 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.16■■■■■ 4.18
NME4-204ENST00000433358 TOP2BQ02880 1626 aa41.09■■■■■ 4.17
NME4-204ENST00000433358 SYNJ1O43426 1573 aa41.06■■■■■ 4.16
NME4-204ENST00000433358 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.05■■■■■ 4.16
NME4-204ENST00000433358 SYNJ2O15056 1496 aa41.03■■■■■ 4.16
NME4-204ENST00000433358 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.01■■■■■ 4.16
NME4-204ENST00000433358 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.97■■■■■ 4.15
NME4-204ENST00000433358 PBRM1Q86U86 1689 aa40.97■■■■■ 4.15
NME4-204ENST00000433358 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.89■■■■■ 4.14
NME4-204ENST00000433358 ARAP1Q96P48 1450 aa40.81■■■■■ 4.12
NME4-204ENST00000433358 GRIN2AQ12879 1464 aa40.7■■■■■ 4.11
NME4-204ENST00000433358 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.67■■■■■ 4.1
NME4-204ENST00000433358 ADAMTS12P58397 1594 aa40.66■■■■■ 4.1
NME4-204ENST00000433358 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.66■■■■■ 4.1
NME4-204ENST00000433358 NUP160Q12769 1436 aa40.56■■■■■ 4.08
NME4-204ENST00000433358 CEP170Q5SW79 1584 aa40.5■■■■■ 4.07
NME4-204ENST00000433358 IGF1RP08069 1367 aa40.37■■■■■ 4.05
NME4-204ENST00000433358 KIF27Q86VH2 1401 aa40.37■■■■■ 4.05
NME4-204ENST00000433358 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.34■■■■■ 4.05
NME4-204ENST00000433358 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.33■■■■■ 4.05
NME4-204ENST00000433358 JPH4Q96JJ6 628 aa40.26■■■■■ 4.04
NME4-204ENST00000433358 SHROOM2Q13796 1616 aa40.25■■■■■ 4.03
NME4-204ENST00000433358 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
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