Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC42.66■■■■■ 4.42
CHGAP10645 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
CHGAP10645 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
CHGAP10645 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
CHGAP10645 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.42
CHGAP10645 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
CHGAP10645 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
CHGAP10645 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
CHGAP10645 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
CHGAP10645 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC42.51■■■■■ 4.4
CHGAP10645 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
CHGAP10645 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC42.44■■■■■ 4.38
CHGAP10645 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
CHGAP10645 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
CHGAP10645 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC42.42■■■■■ 4.38
CHGAP10645 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
CHGAP10645 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
CHGAP10645 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
CHGAP10645 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
CHGAP10645 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
CHGAP10645 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
CHGAP10645 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
CHGAP10645 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
CHGAP10645 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
CHGAP10645 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
CHGAP10645 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
CHGAP10645 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
CHGAP10645 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
CHGAP10645 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
CHGAP10645 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
CHGAP10645 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
CHGAP10645 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC41.99■■■■■ 4.31
CHGAP10645 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
CHGAP10645 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
CHGAP10645 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
CHGAP10645 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC41.96■■■■■ 4.31
CHGAP10645 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
CHGAP10645 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC41.94■■■■■ 4.3
CHGAP10645 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
CHGAP10645 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC41.88■■■■■ 4.29
CHGAP10645 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
CHGAP10645 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
CHGAP10645 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
CHGAP10645 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
CHGAP10645 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
CHGAP10645 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC41.8■■■■■ 4.28
CHGAP10645 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
CHGAP10645 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC41.67■■■■■ 4.26
CHGAP10645 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
CHGAP10645 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
CHGAP10645 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC41.65■■■■■ 4.26
CHGAP10645 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
CHGAP10645 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC41.63■■■■■ 4.25
CHGAP10645 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
CHGAP10645 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
CHGAP10645 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
CHGAP10645 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
CHGAP10645 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
CHGAP10645 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
CHGAP10645 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC41.53■■■■■ 4.24
CHGAP10645 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
CHGAP10645 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
CHGAP10645 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
CHGAP10645 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
CHGAP10645 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
CHGAP10645 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
CHGAP10645 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC41.45■■■■■ 4.23
CHGAP10645 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
CHGAP10645 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
CHGAP10645 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
CHGAP10645 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
CHGAP10645 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
CHGAP10645 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
CHGAP10645 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
CHGAP10645 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
CHGAP10645 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
CHGAP10645 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC41.27■■■■■ 4.2
CHGAP10645 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.23■■■■■ 4.19
CHGAP10645 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
CHGAP10645 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
CHGAP10645 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CHGAP10645 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
CHGAP10645 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
CHGAP10645 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
CHGAP10645 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
CHGAP10645 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
CHGAP10645 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
CHGAP10645 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
CHGAP10645 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
CHGAP10645 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CHGAP10645 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
CHGAP10645 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
CHGAP10645 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
CHGAP10645 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
CHGAP10645 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC40.94■■■■■ 4.15
CHGAP10645 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC40.94■■■■■ 4.14
CHGAP10645 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CHGAP10645 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CHGAP10645 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
CHGAP10645 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms