Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ54

PMF1-BGLAP, HCG2044777, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1-BGLAPU3KQ54 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PMF1-BGLAPU3KQ54 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PMF1-BGLAPU3KQ54 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PMF1-BGLAPU3KQ54 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PMF1-BGLAPU3KQ54 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PMF1-BGLAPU3KQ54 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PMF1-BGLAPU3KQ54 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMF1-BGLAPU3KQ54 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PMF1-BGLAPU3KQ54 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMF1-BGLAPU3KQ54 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMF1-BGLAPU3KQ54 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMF1-BGLAPU3KQ54 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMF1-BGLAPU3KQ54 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMF1-BGLAPU3KQ54 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMF1-BGLAPU3KQ54 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMF1-BGLAPU3KQ54 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMF1-BGLAPU3KQ54 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMF1-BGLAPU3KQ54 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMF1-BGLAPU3KQ54 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMF1-BGLAPU3KQ54 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMF1-BGLAPU3KQ54 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMF1-BGLAPU3KQ54 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMF1-BGLAPU3KQ54 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PMF1-BGLAPU3KQ54 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMF1-BGLAPU3KQ54 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMF1-BGLAPU3KQ54 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMF1-BGLAPU3KQ54 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMF1-BGLAPU3KQ54 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMF1-BGLAPU3KQ54 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMF1-BGLAPU3KQ54 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMF1-BGLAPU3KQ54 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMF1-BGLAPU3KQ54 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMF1-BGLAPU3KQ54 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMF1-BGLAPU3KQ54 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMF1-BGLAPU3KQ54 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMF1-BGLAPU3KQ54 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMF1-BGLAPU3KQ54 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMF1-BGLAPU3KQ54 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMF1-BGLAPU3KQ54 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMF1-BGLAPU3KQ54 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMF1-BGLAPU3KQ54 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMF1-BGLAPU3KQ54 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMF1-BGLAPU3KQ54 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PMF1-BGLAPU3KQ54 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PMF1-BGLAPU3KQ54 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PMF1-BGLAPU3KQ54 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PMF1-BGLAPU3KQ54 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PMF1-BGLAPU3KQ54 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMF1-BGLAPU3KQ54 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMF1-BGLAPU3KQ54 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMF1-BGLAPU3KQ54 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMF1-BGLAPU3KQ54 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMF1-BGLAPU3KQ54 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMF1-BGLAPU3KQ54 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMF1-BGLAPU3KQ54 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMF1-BGLAPU3KQ54 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMF1-BGLAPU3KQ54 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMF1-BGLAPU3KQ54 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMF1-BGLAPU3KQ54 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMF1-BGLAPU3KQ54 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMF1-BGLAPU3KQ54 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMF1-BGLAPU3KQ54 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMF1-BGLAPU3KQ54 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMF1-BGLAPU3KQ54 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMF1-BGLAPU3KQ54 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PMF1-BGLAPU3KQ54 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMF1-BGLAPU3KQ54 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMF1-BGLAPU3KQ54 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMF1-BGLAPU3KQ54 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMF1-BGLAPU3KQ54 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMF1-BGLAPU3KQ54 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMF1-BGLAPU3KQ54 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMF1-BGLAPU3KQ54 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMF1-BGLAPU3KQ54 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMF1-BGLAPU3KQ54 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMF1-BGLAPU3KQ54 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMF1-BGLAPU3KQ54 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMF1-BGLAPU3KQ54 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMF1-BGLAPU3KQ54 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMF1-BGLAPU3KQ54 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMF1-BGLAPU3KQ54 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMF1-BGLAPU3KQ54 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMF1-BGLAPU3KQ54 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMF1-BGLAPU3KQ54 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMF1-BGLAPU3KQ54 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMF1-BGLAPU3KQ54 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMF1-BGLAPU3KQ54 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMF1-BGLAPU3KQ54 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PMF1-BGLAPU3KQ54 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMF1-BGLAPU3KQ54 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMF1-BGLAPU3KQ54 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMF1-BGLAPU3KQ54 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms