Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX10Q9Y5X0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX10Q9Y5X0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX10Q9Y5X0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX10Q9Y5X0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX10Q9Y5X0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX10Q9Y5X0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX10Q9Y5X0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX10Q9Y5X0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX10Q9Y5X0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX10Q9Y5X0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX10Q9Y5X0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX10Q9Y5X0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX10Q9Y5X0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX10Q9Y5X0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX10Q9Y5X0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX10Q9Y5X0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX10Q9Y5X0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX10Q9Y5X0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX10Q9Y5X0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX10Q9Y5X0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX10Q9Y5X0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX10Q9Y5X0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX10Q9Y5X0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX10Q9Y5X0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX10Q9Y5X0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX10Q9Y5X0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX10Q9Y5X0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX10Q9Y5X0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX10Q9Y5X0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX10Q9Y5X0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX10Q9Y5X0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX10Q9Y5X0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX10Q9Y5X0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX10Q9Y5X0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX10Q9Y5X0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX10Q9Y5X0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SNX10Q9Y5X0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX10Q9Y5X0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX10Q9Y5X0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX10Q9Y5X0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX10Q9Y5X0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX10Q9Y5X0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX10Q9Y5X0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX10Q9Y5X0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX10Q9Y5X0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX10Q9Y5X0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX10Q9Y5X0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX10Q9Y5X0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX10Q9Y5X0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX10Q9Y5X0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX10Q9Y5X0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX10Q9Y5X0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX10Q9Y5X0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX10Q9Y5X0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX10Q9Y5X0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX10Q9Y5X0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX10Q9Y5X0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX10Q9Y5X0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX10Q9Y5X0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX10Q9Y5X0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX10Q9Y5X0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX10Q9Y5X0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX10Q9Y5X0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX10Q9Y5X0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX10Q9Y5X0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX10Q9Y5X0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX10Q9Y5X0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX10Q9Y5X0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX10Q9Y5X0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX10Q9Y5X0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX10Q9Y5X0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX10Q9Y5X0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX10Q9Y5X0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX10Q9Y5X0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX10Q9Y5X0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX10Q9Y5X0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX10Q9Y5X0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX10Q9Y5X0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX10Q9Y5X0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX10Q9Y5X0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX10Q9Y5X0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX10Q9Y5X0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX10Q9Y5X0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX10Q9Y5X0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX10Q9Y5X0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX10Q9Y5X0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX10Q9Y5X0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX10Q9Y5X0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX10Q9Y5X0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX10Q9Y5X0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX10Q9Y5X0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX10Q9Y5X0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX10Q9Y5X0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX10Q9Y5X0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX10Q9Y5X0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX10Q9Y5X0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX10Q9Y5X0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX10Q9Y5X0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX10Q9Y5X0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms