Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FAN1Q9Y2M0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FAN1Q9Y2M0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAN1Q9Y2M0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAN1Q9Y2M0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAN1Q9Y2M0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAN1Q9Y2M0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAN1Q9Y2M0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAN1Q9Y2M0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAN1Q9Y2M0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAN1Q9Y2M0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAN1Q9Y2M0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAN1Q9Y2M0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAN1Q9Y2M0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FAN1Q9Y2M0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FAN1Q9Y2M0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAN1Q9Y2M0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
FAN1Q9Y2M0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAN1Q9Y2M0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FAN1Q9Y2M0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAN1Q9Y2M0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FAN1Q9Y2M0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FAN1Q9Y2M0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FAN1Q9Y2M0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FAN1Q9Y2M0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FAN1Q9Y2M0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FAN1Q9Y2M0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FAN1Q9Y2M0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAN1Q9Y2M0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAN1Q9Y2M0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAN1Q9Y2M0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAN1Q9Y2M0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAN1Q9Y2M0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAN1Q9Y2M0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAN1Q9Y2M0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAN1Q9Y2M0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAN1Q9Y2M0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAN1Q9Y2M0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAN1Q9Y2M0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAN1Q9Y2M0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAN1Q9Y2M0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAN1Q9Y2M0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FAN1Q9Y2M0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FAN1Q9Y2M0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FAN1Q9Y2M0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
FAN1Q9Y2M0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FAN1Q9Y2M0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FAN1Q9Y2M0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FAN1Q9Y2M0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FAN1Q9Y2M0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAN1Q9Y2M0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
FAN1Q9Y2M0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAN1Q9Y2M0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAN1Q9Y2M0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAN1Q9Y2M0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAN1Q9Y2M0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAN1Q9Y2M0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAN1Q9Y2M0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAN1Q9Y2M0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAN1Q9Y2M0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAN1Q9Y2M0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAN1Q9Y2M0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAN1Q9Y2M0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
FAN1Q9Y2M0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAN1Q9Y2M0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAN1Q9Y2M0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAN1Q9Y2M0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAN1Q9Y2M0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
FAN1Q9Y2M0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAN1Q9Y2M0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAN1Q9Y2M0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAN1Q9Y2M0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FAN1Q9Y2M0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FAN1Q9Y2M0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FAN1Q9Y2M0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FAN1Q9Y2M0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FAN1Q9Y2M0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FAN1Q9Y2M0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAN1Q9Y2M0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
FAN1Q9Y2M0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAN1Q9Y2M0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAN1Q9Y2M0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
FAN1Q9Y2M0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAN1Q9Y2M0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAN1Q9Y2M0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAN1Q9Y2M0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAN1Q9Y2M0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAN1Q9Y2M0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAN1Q9Y2M0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAN1Q9Y2M0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAN1Q9Y2M0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAN1Q9Y2M0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAN1Q9Y2M0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAN1Q9Y2M0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAN1Q9Y2M0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAN1Q9Y2M0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAN1Q9Y2M0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAN1Q9Y2M0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAN1Q9Y2M0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAN1Q9Y2M0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms