Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDH7Q9ULB5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDH7Q9ULB5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDH7Q9ULB5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDH7Q9ULB5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDH7Q9ULB5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDH7Q9ULB5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CDH7Q9ULB5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDH7Q9ULB5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDH7Q9ULB5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CDH7Q9ULB5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDH7Q9ULB5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDH7Q9ULB5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDH7Q9ULB5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDH7Q9ULB5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDH7Q9ULB5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDH7Q9ULB5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CDH7Q9ULB5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDH7Q9ULB5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDH7Q9ULB5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDH7Q9ULB5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDH7Q9ULB5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH7Q9ULB5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH7Q9ULB5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH7Q9ULB5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH7Q9ULB5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH7Q9ULB5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH7Q9ULB5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH7Q9ULB5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDH7Q9ULB5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDH7Q9ULB5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDH7Q9ULB5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDH7Q9ULB5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDH7Q9ULB5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDH7Q9ULB5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDH7Q9ULB5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDH7Q9ULB5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDH7Q9ULB5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDH7Q9ULB5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CDH7Q9ULB5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDH7Q9ULB5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDH7Q9ULB5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDH7Q9ULB5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH7Q9ULB5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDH7Q9ULB5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDH7Q9ULB5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDH7Q9ULB5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDH7Q9ULB5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDH7Q9ULB5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDH7Q9ULB5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDH7Q9ULB5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDH7Q9ULB5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDH7Q9ULB5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDH7Q9ULB5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDH7Q9ULB5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDH7Q9ULB5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDH7Q9ULB5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDH7Q9ULB5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CDH7Q9ULB5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDH7Q9ULB5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CDH7Q9ULB5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDH7Q9ULB5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDH7Q9ULB5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDH7Q9ULB5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDH7Q9ULB5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDH7Q9ULB5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CDH7Q9ULB5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDH7Q9ULB5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDH7Q9ULB5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDH7Q9ULB5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CDH7Q9ULB5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDH7Q9ULB5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDH7Q9ULB5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDH7Q9ULB5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CDH7Q9ULB5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDH7Q9ULB5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDH7Q9ULB5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDH7Q9ULB5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDH7Q9ULB5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDH7Q9ULB5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDH7Q9ULB5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CDH7Q9ULB5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDH7Q9ULB5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CDH7Q9ULB5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDH7Q9ULB5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CDH7Q9ULB5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDH7Q9ULB5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDH7Q9ULB5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDH7Q9ULB5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDH7Q9ULB5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDH7Q9ULB5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CDH7Q9ULB5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDH7Q9ULB5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDH7Q9ULB5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDH7Q9ULB5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDH7Q9ULB5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDH7Q9ULB5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDH7Q9ULB5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDH7Q9ULB5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDH7Q9ULB5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms