Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ9

PCOLCE2, Procollagen C-endopeptidase enhancer 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCE2Q9UKZ9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCOLCE2Q9UKZ9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCOLCE2Q9UKZ9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCOLCE2Q9UKZ9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCOLCE2Q9UKZ9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCOLCE2Q9UKZ9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCOLCE2Q9UKZ9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCOLCE2Q9UKZ9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PCOLCE2Q9UKZ9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PCOLCE2Q9UKZ9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCOLCE2Q9UKZ9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCOLCE2Q9UKZ9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCOLCE2Q9UKZ9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCOLCE2Q9UKZ9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCOLCE2Q9UKZ9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCOLCE2Q9UKZ9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCOLCE2Q9UKZ9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCOLCE2Q9UKZ9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCOLCE2Q9UKZ9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCOLCE2Q9UKZ9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCOLCE2Q9UKZ9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCOLCE2Q9UKZ9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCOLCE2Q9UKZ9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCOLCE2Q9UKZ9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCOLCE2Q9UKZ9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCOLCE2Q9UKZ9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCOLCE2Q9UKZ9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCOLCE2Q9UKZ9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCOLCE2Q9UKZ9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCOLCE2Q9UKZ9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PCOLCE2Q9UKZ9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCOLCE2Q9UKZ9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCOLCE2Q9UKZ9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCOLCE2Q9UKZ9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCOLCE2Q9UKZ9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCOLCE2Q9UKZ9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCOLCE2Q9UKZ9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PCOLCE2Q9UKZ9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCOLCE2Q9UKZ9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCOLCE2Q9UKZ9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCOLCE2Q9UKZ9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCOLCE2Q9UKZ9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCOLCE2Q9UKZ9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCOLCE2Q9UKZ9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCOLCE2Q9UKZ9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCOLCE2Q9UKZ9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCOLCE2Q9UKZ9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PCOLCE2Q9UKZ9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCOLCE2Q9UKZ9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCOLCE2Q9UKZ9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCOLCE2Q9UKZ9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCOLCE2Q9UKZ9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCOLCE2Q9UKZ9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PCOLCE2Q9UKZ9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PCOLCE2Q9UKZ9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCOLCE2Q9UKZ9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCOLCE2Q9UKZ9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCOLCE2Q9UKZ9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PCOLCE2Q9UKZ9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCOLCE2Q9UKZ9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCOLCE2Q9UKZ9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCOLCE2Q9UKZ9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCOLCE2Q9UKZ9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCOLCE2Q9UKZ9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCOLCE2Q9UKZ9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PCOLCE2Q9UKZ9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCOLCE2Q9UKZ9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCOLCE2Q9UKZ9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCOLCE2Q9UKZ9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCOLCE2Q9UKZ9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCOLCE2Q9UKZ9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCOLCE2Q9UKZ9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCOLCE2Q9UKZ9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCOLCE2Q9UKZ9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCOLCE2Q9UKZ9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCOLCE2Q9UKZ9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCOLCE2Q9UKZ9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PCOLCE2Q9UKZ9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCOLCE2Q9UKZ9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCOLCE2Q9UKZ9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCOLCE2Q9UKZ9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PCOLCE2Q9UKZ9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCOLCE2Q9UKZ9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCOLCE2Q9UKZ9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PCOLCE2Q9UKZ9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCOLCE2Q9UKZ9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCOLCE2Q9UKZ9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCOLCE2Q9UKZ9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCOLCE2Q9UKZ9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCOLCE2Q9UKZ9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PCOLCE2Q9UKZ9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCOLCE2Q9UKZ9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCOLCE2Q9UKZ9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms