Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK13

ZNF221, Zinc finger protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF221Q9UK13 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF221Q9UK13 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF221Q9UK13 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF221Q9UK13 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF221Q9UK13 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF221Q9UK13 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF221Q9UK13 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF221Q9UK13 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF221Q9UK13 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF221Q9UK13 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF221Q9UK13 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF221Q9UK13 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF221Q9UK13 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF221Q9UK13 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF221Q9UK13 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF221Q9UK13 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF221Q9UK13 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF221Q9UK13 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF221Q9UK13 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF221Q9UK13 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF221Q9UK13 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF221Q9UK13 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF221Q9UK13 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF221Q9UK13 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF221Q9UK13 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF221Q9UK13 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF221Q9UK13 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF221Q9UK13 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF221Q9UK13 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF221Q9UK13 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF221Q9UK13 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF221Q9UK13 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF221Q9UK13 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF221Q9UK13 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF221Q9UK13 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF221Q9UK13 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF221Q9UK13 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF221Q9UK13 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF221Q9UK13 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF221Q9UK13 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF221Q9UK13 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF221Q9UK13 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF221Q9UK13 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF221Q9UK13 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF221Q9UK13 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF221Q9UK13 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF221Q9UK13 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF221Q9UK13 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF221Q9UK13 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF221Q9UK13 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF221Q9UK13 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF221Q9UK13 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF221Q9UK13 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF221Q9UK13 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF221Q9UK13 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF221Q9UK13 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF221Q9UK13 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF221Q9UK13 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF221Q9UK13 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF221Q9UK13 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF221Q9UK13 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF221Q9UK13 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF221Q9UK13 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF221Q9UK13 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF221Q9UK13 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF221Q9UK13 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF221Q9UK13 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF221Q9UK13 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF221Q9UK13 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF221Q9UK13 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF221Q9UK13 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF221Q9UK13 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF221Q9UK13 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF221Q9UK13 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF221Q9UK13 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF221Q9UK13 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF221Q9UK13 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF221Q9UK13 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF221Q9UK13 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF221Q9UK13 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF221Q9UK13 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF221Q9UK13 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF221Q9UK13 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF221Q9UK13 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF221Q9UK13 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF221Q9UK13 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF221Q9UK13 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF221Q9UK13 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF221Q9UK13 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF221Q9UK13 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF221Q9UK13 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF221Q9UK13 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF221Q9UK13 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF221Q9UK13 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF221Q9UK13 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF221Q9UK13 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF221Q9UK13 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF221Q9UK13 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF221Q9UK13 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF221Q9UK13 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms