Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF2IRD1Q9UHL9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF2IRD1Q9UHL9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF2IRD1Q9UHL9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GTF2IRD1Q9UHL9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GTF2IRD1Q9UHL9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GTF2IRD1Q9UHL9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GTF2IRD1Q9UHL9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GTF2IRD1Q9UHL9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF2IRD1Q9UHL9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GTF2IRD1Q9UHL9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GTF2IRD1Q9UHL9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GTF2IRD1Q9UHL9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GTF2IRD1Q9UHL9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GTF2IRD1Q9UHL9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GTF2IRD1Q9UHL9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF2IRD1Q9UHL9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF2IRD1Q9UHL9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF2IRD1Q9UHL9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF2IRD1Q9UHL9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF2IRD1Q9UHL9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF2IRD1Q9UHL9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF2IRD1Q9UHL9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF2IRD1Q9UHL9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF2IRD1Q9UHL9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF2IRD1Q9UHL9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF2IRD1Q9UHL9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTF2IRD1Q9UHL9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF2IRD1Q9UHL9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF2IRD1Q9UHL9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF2IRD1Q9UHL9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF2IRD1Q9UHL9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF2IRD1Q9UHL9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF2IRD1Q9UHL9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF2IRD1Q9UHL9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF2IRD1Q9UHL9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF2IRD1Q9UHL9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF2IRD1Q9UHL9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF2IRD1Q9UHL9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF2IRD1Q9UHL9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF2IRD1Q9UHL9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF2IRD1Q9UHL9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF2IRD1Q9UHL9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF2IRD1Q9UHL9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF2IRD1Q9UHL9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF2IRD1Q9UHL9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF2IRD1Q9UHL9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2IRD1Q9UHL9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2IRD1Q9UHL9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2IRD1Q9UHL9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2IRD1Q9UHL9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2IRD1Q9UHL9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2IRD1Q9UHL9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GTF2IRD1Q9UHL9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GTF2IRD1Q9UHL9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GTF2IRD1Q9UHL9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF2IRD1Q9UHL9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF2IRD1Q9UHL9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GTF2IRD1Q9UHL9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GTF2IRD1Q9UHL9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF2IRD1Q9UHL9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF2IRD1Q9UHL9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF2IRD1Q9UHL9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF2IRD1Q9UHL9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF2IRD1Q9UHL9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF2IRD1Q9UHL9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2IRD1Q9UHL9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2IRD1Q9UHL9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2IRD1Q9UHL9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2IRD1Q9UHL9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2IRD1Q9UHL9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2IRD1Q9UHL9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF2IRD1Q9UHL9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF2IRD1Q9UHL9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF2IRD1Q9UHL9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF2IRD1Q9UHL9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF2IRD1Q9UHL9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF2IRD1Q9UHL9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF2IRD1Q9UHL9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF2IRD1Q9UHL9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF2IRD1Q9UHL9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
GTF2IRD1Q9UHL9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
GTF2IRD1Q9UHL9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF2IRD1Q9UHL9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF2IRD1Q9UHL9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF2IRD1Q9UHL9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF2IRD1Q9UHL9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF2IRD1Q9UHL9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF2IRD1Q9UHL9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF2IRD1Q9UHL9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF2IRD1Q9UHL9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF2IRD1Q9UHL9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms