Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ6

SHPK, Sedoheptulokinase, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPKQ9UHJ6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHPKQ9UHJ6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHPKQ9UHJ6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHPKQ9UHJ6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHPKQ9UHJ6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHPKQ9UHJ6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHPKQ9UHJ6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHPKQ9UHJ6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SHPKQ9UHJ6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SHPKQ9UHJ6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHPKQ9UHJ6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHPKQ9UHJ6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHPKQ9UHJ6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHPKQ9UHJ6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHPKQ9UHJ6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SHPKQ9UHJ6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHPKQ9UHJ6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHPKQ9UHJ6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHPKQ9UHJ6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHPKQ9UHJ6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHPKQ9UHJ6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHPKQ9UHJ6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SHPKQ9UHJ6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHPKQ9UHJ6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHPKQ9UHJ6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHPKQ9UHJ6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHPKQ9UHJ6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHPKQ9UHJ6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHPKQ9UHJ6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHPKQ9UHJ6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHPKQ9UHJ6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHPKQ9UHJ6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHPKQ9UHJ6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHPKQ9UHJ6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHPKQ9UHJ6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHPKQ9UHJ6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHPKQ9UHJ6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHPKQ9UHJ6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHPKQ9UHJ6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHPKQ9UHJ6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHPKQ9UHJ6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHPKQ9UHJ6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHPKQ9UHJ6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHPKQ9UHJ6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SHPKQ9UHJ6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHPKQ9UHJ6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SHPKQ9UHJ6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHPKQ9UHJ6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHPKQ9UHJ6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SHPKQ9UHJ6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHPKQ9UHJ6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHPKQ9UHJ6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHPKQ9UHJ6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHPKQ9UHJ6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHPKQ9UHJ6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHPKQ9UHJ6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHPKQ9UHJ6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHPKQ9UHJ6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHPKQ9UHJ6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHPKQ9UHJ6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHPKQ9UHJ6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHPKQ9UHJ6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHPKQ9UHJ6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHPKQ9UHJ6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHPKQ9UHJ6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms