Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TMOD4Q9NZQ9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TMOD4Q9NZQ9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TMOD4Q9NZQ9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TMOD4Q9NZQ9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TMOD4Q9NZQ9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TMOD4Q9NZQ9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TMOD4Q9NZQ9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TMOD4Q9NZQ9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TMOD4Q9NZQ9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TMOD4Q9NZQ9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TMOD4Q9NZQ9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TMOD4Q9NZQ9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TMOD4Q9NZQ9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TMOD4Q9NZQ9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TMOD4Q9NZQ9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TMOD4Q9NZQ9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TMOD4Q9NZQ9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TMOD4Q9NZQ9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TMOD4Q9NZQ9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TMOD4Q9NZQ9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TMOD4Q9NZQ9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMOD4Q9NZQ9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMOD4Q9NZQ9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMOD4Q9NZQ9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMOD4Q9NZQ9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMOD4Q9NZQ9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMOD4Q9NZQ9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TMOD4Q9NZQ9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TMOD4Q9NZQ9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TMOD4Q9NZQ9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TMOD4Q9NZQ9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TMOD4Q9NZQ9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TMOD4Q9NZQ9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TMOD4Q9NZQ9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TMOD4Q9NZQ9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMOD4Q9NZQ9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMOD4Q9NZQ9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMOD4Q9NZQ9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMOD4Q9NZQ9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMOD4Q9NZQ9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMOD4Q9NZQ9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMOD4Q9NZQ9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMOD4Q9NZQ9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMOD4Q9NZQ9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TMOD4Q9NZQ9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TMOD4Q9NZQ9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMOD4Q9NZQ9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TMOD4Q9NZQ9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TMOD4Q9NZQ9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TMOD4Q9NZQ9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
TMOD4Q9NZQ9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
TMOD4Q9NZQ9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMOD4Q9NZQ9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMOD4Q9NZQ9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMOD4Q9NZQ9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMOD4Q9NZQ9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMOD4Q9NZQ9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMOD4Q9NZQ9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMOD4Q9NZQ9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMOD4Q9NZQ9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMOD4Q9NZQ9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMOD4Q9NZQ9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMOD4Q9NZQ9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TMOD4Q9NZQ9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TMOD4Q9NZQ9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMOD4Q9NZQ9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMOD4Q9NZQ9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMOD4Q9NZQ9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMOD4Q9NZQ9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMOD4Q9NZQ9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TMOD4Q9NZQ9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TMOD4Q9NZQ9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMOD4Q9NZQ9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMOD4Q9NZQ9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMOD4Q9NZQ9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMOD4Q9NZQ9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
TMOD4Q9NZQ9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMOD4Q9NZQ9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMOD4Q9NZQ9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMOD4Q9NZQ9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMOD4Q9NZQ9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMOD4Q9NZQ9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMOD4Q9NZQ9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMOD4Q9NZQ9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMOD4Q9NZQ9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMOD4Q9NZQ9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMOD4Q9NZQ9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMOD4Q9NZQ9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMOD4Q9NZQ9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMOD4Q9NZQ9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMOD4Q9NZQ9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMOD4Q9NZQ9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMOD4Q9NZQ9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TMOD4Q9NZQ9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMOD4Q9NZQ9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMOD4Q9NZQ9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMOD4Q9NZQ9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TMOD4Q9NZQ9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMOD4Q9NZQ9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms