Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKIRAS2Q9NYR9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKIRAS2Q9NYR9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKIRAS2Q9NYR9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NKIRAS2Q9NYR9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKIRAS2Q9NYR9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKIRAS2Q9NYR9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKIRAS2Q9NYR9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKIRAS2Q9NYR9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKIRAS2Q9NYR9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKIRAS2Q9NYR9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKIRAS2Q9NYR9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKIRAS2Q9NYR9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKIRAS2Q9NYR9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKIRAS2Q9NYR9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKIRAS2Q9NYR9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKIRAS2Q9NYR9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKIRAS2Q9NYR9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKIRAS2Q9NYR9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKIRAS2Q9NYR9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKIRAS2Q9NYR9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKIRAS2Q9NYR9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKIRAS2Q9NYR9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKIRAS2Q9NYR9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NKIRAS2Q9NYR9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKIRAS2Q9NYR9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKIRAS2Q9NYR9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKIRAS2Q9NYR9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKIRAS2Q9NYR9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKIRAS2Q9NYR9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKIRAS2Q9NYR9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKIRAS2Q9NYR9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKIRAS2Q9NYR9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKIRAS2Q9NYR9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKIRAS2Q9NYR9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKIRAS2Q9NYR9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKIRAS2Q9NYR9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKIRAS2Q9NYR9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NKIRAS2Q9NYR9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKIRAS2Q9NYR9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKIRAS2Q9NYR9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKIRAS2Q9NYR9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKIRAS2Q9NYR9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKIRAS2Q9NYR9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKIRAS2Q9NYR9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKIRAS2Q9NYR9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKIRAS2Q9NYR9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKIRAS2Q9NYR9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKIRAS2Q9NYR9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKIRAS2Q9NYR9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKIRAS2Q9NYR9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKIRAS2Q9NYR9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKIRAS2Q9NYR9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKIRAS2Q9NYR9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKIRAS2Q9NYR9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKIRAS2Q9NYR9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKIRAS2Q9NYR9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NKIRAS2Q9NYR9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKIRAS2Q9NYR9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKIRAS2Q9NYR9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKIRAS2Q9NYR9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKIRAS2Q9NYR9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKIRAS2Q9NYR9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKIRAS2Q9NYR9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKIRAS2Q9NYR9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKIRAS2Q9NYR9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKIRAS2Q9NYR9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKIRAS2Q9NYR9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKIRAS2Q9NYR9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKIRAS2Q9NYR9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms