Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU7

SDAD1, Protein SDA1 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDAD1Q9NVU7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.38e-7■■■■■ 40.9
SDAD1Q9NVU7 TM9SF1-208ENST00000529332 2107 ntTSL 516.22■□□□□ 0.198e-7■■■■■ 40.9
SDAD1Q9NVU7 SGSM2-213ENST00000574857 3885 ntTSL 215.57■□□□□ 0.088e-7■■■■■ 40.9
SDAD1Q9NVU7 B4GALNT4-203ENST00000526584 421 ntTSL 315.54■□□□□ 0.088e-7■■■■■ 40.9
SDAD1Q9NVU7 B4GALNT4-205ENST00000534778 876 ntTSL 315.1■□□□□ 0.018e-7■■■■■ 40.9
SDAD1Q9NVU7 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.058e-7■■■■■ 40.9
SDAD1Q9NVU7 TM9SF1-209ENST00000530468 1065 ntTSL 214.39□□□□□ -0.118e-7■■■■■ 40.9
SDAD1Q9NVU7 TM9SF1-205ENST00000528010 904 ntTSL 214.39□□□□□ -0.118e-7■■■■■ 40.9
SDAD1Q9NVU7 HNRNPL-213ENST00000601664 447 ntTSL 1 (best)14.34□□□□□ -0.118e-7■■■■■ 40.9
SDAD1Q9NVU7 TM9SF1-212ENST00000532632 505 ntTSL 313.73□□□□□ -0.218e-7■■■■■ 40.9
SDAD1Q9NVU7 DNMT1-213ENST00000587604 513 ntTSL 212.94□□□□□ -0.348e-7■■■■■ 40.9
SDAD1Q9NVU7 COPG1-207ENST00000513410 545 ntTSL 212.59□□□□□ -0.398e-7■■■■■ 40.9
SDAD1Q9NVU7 SGSM2-203ENST00000570431 392 ntTSL 312□□□□□ -0.498e-7■■■■■ 40.9
SDAD1Q9NVU7 ABCF1-205ENST00000475993 2860 ntTSL 1 (best)11.43□□□□□ -0.588e-7■■■■■ 40.9
SDAD1Q9NVU7 AL136295.1-201ENST00000530611 2740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.618e-7■■■■■ 40.9
SDAD1Q9NVU7 TM9SF1-207ENST00000528895 961 ntTSL 211.18□□□□□ -0.628e-7■■■■■ 40.9
SDAD1Q9NVU7 ABCF1-202ENST00000376545 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.658e-7■■■■■ 40.9
SDAD1Q9NVU7 ABCF1-201ENST00000326195 3481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.678e-7■■■■■ 40.9
SDAD1Q9NVU7 TM9SF1-210ENST00000530563 721 ntTSL 39.68□□□□□ -0.868e-7■■■■■ 40.9
SDAD1Q9NVU7 COPG1-210ENST00000515725 3231 ntTSL 28.9□□□□□ -0.988e-7■■■■■ 40.9
SDAD1Q9NVU7 ABCF1-203ENST00000441867 1074 ntTSL 58.41□□□□□ -1.068e-7■■■■■ 40.9
SDAD1Q9NVU7 COPG1-201ENST00000314797 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.088e-7■■■■■ 40.9
SDAD1Q9NVU7 ATP11A-209ENST00000466946 431 ntTSL 57.05□□□□□ -1.288e-7■■■■■ 40.9
SDAD1Q9NVU7 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.558e-7■■■■■ 40.9
SDAD1Q9NVU7 ALCAM-203ENST00000465413 2496 ntTSL 24.98□□□□□ -1.618e-7■■■■■ 40.9
SDAD1Q9NVU7 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.718e-7■■■■■ 40.9
SDAD1Q9NVU7 ALCAM-206ENST00000481337 1242 ntTSL 23.44□□□□□ -1.868e-7■■■■■ 40.9
SDAD1Q9NVU7 MYO18A-216ENST00000533420 1168 ntTSL 513.23□□□□□ -0.292e-13■■■■■ 40.7
SDAD1Q9NVU7 MYO18A-210ENST00000531267 334 ntTSL 210.89□□□□□ -0.672e-13■■■■■ 40.7
SDAD1Q9NVU7 MYO18A-219ENST00000585573 319 ntTSL 310.73□□□□□ -0.692e-13■■■■■ 40.7
SDAD1Q9NVU7 HECTD4-201ENST00000311694 2734 ntTSL 28.46□□□□□ -1.063e-6■■■■■ 40.4
SDAD1Q9NVU7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.372e-7■■■■■ 40.4
SDAD1Q9NVU7 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 40.4
SDAD1Q9NVU7 SEMA4G-209ENST00000519649 2024 ntTSL 516.17■□□□□ 0.181e-6■■■■■ 40.3
SDAD1Q9NVU7 SEMA4G-210ENST00000519756 728 ntTSL 512.47□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 40.3
SDAD1Q9NVU7 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 40.2
SDAD1Q9NVU7 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 40.2
SDAD1Q9NVU7 RNF19A-211ENST00000523167 792 ntTSL 423.47■■□□□ 1.352e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.332e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.212e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.142e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 HSF4-224ENST00000523562 1839 ntTSL 221.75■■□□□ 1.072e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 HSF4-214ENST00000521314 1555 ntTSL 521.7■■□□□ 1.062e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.042e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 HSF4-222ENST00000522870 1599 ntTSL 521.52■■□□□ 1.042e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.992e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.982e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 CADM1-207ENST00000537140 1646 ntTSL 1 (best)21.05■□□□□ 0.962e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 MYO15B-235ENST00000621743 8646 ntTSL 520.98■□□□□ 0.952e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 MYO15B-234ENST00000619501 7167 ntTSL 520.76■□□□□ 0.912e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 HSF4-220ENST00000522295 1539 ntTSL 519.91■□□□□ 0.782e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 HSF4-203ENST00000517685 1249 ntTSL 519.86■□□□□ 0.772e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.752e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 HSF4-201ENST00000434833 1568 ntTSL 1 (best)19.73■□□□□ 0.752e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.62e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.62e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 HSF4-204ENST00000517729 556 ntTSL 518.64■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 HSF4-216ENST00000521624 1358 ntTSL 1 (best)18.44■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.532e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 CADM1-218ENST00000545380 2373 ntTSL 1 (best)17.74■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 NUMA1-213ENST00000537217 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)17.49■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 TRIM56-202ENST00000412507 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)17.45■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 EIF2B5-212ENST00000491144 3038 ntTSL 217.26■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 FIS1-206ENST00000473527 1005 ntTSL 1 (best)17.21■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 SUN2-213ENST00000464202 541 ntTSL 216.86■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 DGKD-210ENST00000474488 1355 ntTSL 516.66■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.55■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 ARRB1-210ENST00000532525 925 ntTSL 515.76■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 EIF2B5-209ENST00000481054 3460 ntTSL 1 (best)15.7■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 FIS1-209ENST00000482199 731 ntTSL 315.45■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 FIS1-204ENST00000449367 745 ntTSL 215.36■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 KDM4B-210ENST00000592175 562 ntTSL 415.2■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 02e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 SUN2-207ENST00000433561 444 ntTSL 414.83□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 HNRNPL-211ENST00000601047 1127 ntTSL 514.78□□□□□ -0.043e-8■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 INPPL1-208ENST00000540329 741 ntTSL 314.74□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 CADM1-211ENST00000541434 1112 ntTSL 1 (best)14.71□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 SUN2-210ENST00000452294 621 ntTSL 414.38□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 HSF4-205ENST00000517750 546 ntTSL 514.3□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.132e-6■■■■■ 39.6
Retrieved 100 of 11,671 protein–RNA pairs in 649.6 ms