RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522295.5

HSF4-220, Transcript of heat shock transcription factor 4, humanhuman

TSL 5

Gene HSF4, Length 1,539 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF4-220ENST00000522295 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.96■■■■■ 5.91
HSF4-220ENST00000522295 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.98■■■■■ 4.95
HSF4-220ENST00000522295 ABCC9O60706 1549 aa44.74■■■■■ 4.75
HSF4-220ENST00000522295 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.38■■■■■ 4.53
HSF4-220ENST00000522295 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.22■■■■■ 4.51
HSF4-220ENST00000522295 NACADO15069 1562 aa43.12■■■■■ 4.49
HSF4-220ENST00000522295 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.08■■■■■ 4.49
HSF4-220ENST00000522295 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.95■■■■■ 4.47
HSF4-220ENST00000522295 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.94■■■■■ 4.46
HSF4-220ENST00000522295 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.31■■■■■ 4.36
HSF4-220ENST00000522295 SCRIBQ14160 1630 aa42.08■■■■■ 4.33
HSF4-220ENST00000522295 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.93■■■■■ 4.3
HSF4-220ENST00000522295 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.88■■■■■ 4.293e-7■■■■□ 21.7
HSF4-220ENST00000522295 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.33■■■■■ 4.21
HSF4-220ENST00000522295 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.84■■■■■ 4.13
HSF4-220ENST00000522295 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.72■■■■■ 4.11
HSF4-220ENST00000522295 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.54■■■■■ 4.08
HSF4-220ENST00000522295 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.47■■■■■ 4.07
HSF4-220ENST00000522295 SMARCA4P51532 1647 aa40.26■■■■■ 4.04
HSF4-220ENST00000522295 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.02
HSF4-220ENST00000522295 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.12■■■■■ 4.01
HSF4-220ENST00000522295 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.94■■■■□ 3.98
HSF4-220ENST00000522295 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.83■■■■□ 3.97
HSF4-220ENST00000522295 NCAPD3P42695 1498 aa39.82■■■■□ 3.97
HSF4-220ENST00000522295 SMARCA2P51531 1590 aa39.82■■■■□ 3.96
HSF4-220ENST00000522295 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.76■■■■□ 3.96
HSF4-220ENST00000522295 WIZO95785 1651 aa39.72■■■■□ 3.95
HSF4-220ENST00000522295 HMGXB3Q12766 1538 aa39.65■■■■□ 3.94
HSF4-220ENST00000522295 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.58■■■■□ 3.93
HSF4-220ENST00000522295 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.23■■■■□ 3.87
HSF4-220ENST00000522295 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.99■■■■□ 3.83
HSF4-220ENST00000522295 NESP48681 1621 aa38.88■■■■□ 3.81
HSF4-220ENST00000522295 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.8■■■■□ 3.8
HSF4-220ENST00000522295 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.68■■■■□ 3.78
HSF4-220ENST00000522295 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.66■■■■□ 3.78
HSF4-220ENST00000522295 CFTRP13569 1480 aa38.54■■■■□ 3.76
HSF4-220ENST00000522295 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.41■■■■□ 3.74
HSF4-220ENST00000522295 ERCC6Q03468 1493 aa38.4■■■■□ 3.74
HSF4-220ENST00000522295 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.35■■■■□ 3.73
HSF4-220ENST00000522295 PRDM2Q13029 1718 aa38.3■■■■□ 3.72
HSF4-220ENST00000522295 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.25■■■■□ 3.71
HSF4-220ENST00000522295 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.17■■■■□ 3.7
HSF4-220ENST00000522295 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.13■■■■□ 3.69
HSF4-220ENST00000522295 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.01■■■■□ 3.68
HSF4-220ENST00000522295 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.91■■■■□ 3.66
HSF4-220ENST00000522295 WDR62O43379 1518 aa37.91■■■■□ 3.66
HSF4-220ENST00000522295 CUX2O14529 1486 aa37.86■■■■□ 3.65
HSF4-220ENST00000522295 TOPBP1Q92547 1522 aa37.7■■■■□ 3.63
HSF4-220ENST00000522295 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.66■■■■□ 3.62
HSF4-220ENST00000522295 CUX1P39880 1505 aa37.61■■■■□ 3.61
HSF4-220ENST00000522295 ABCC8Q09428 1581 aa37.57■■■■□ 3.6
HSF4-220ENST00000522295 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.42■■■■□ 3.58
HSF4-220ENST00000522295 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.41■■■■□ 3.58
HSF4-220ENST00000522295 SYNJ1O43426 1573 aa37.41■■■■□ 3.58
HSF4-220ENST00000522295 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.38■■■■□ 3.57
HSF4-220ENST00000522295 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.33■■■■□ 3.57
HSF4-220ENST00000522295 TOP2BQ02880 1626 aa37.32■■■■□ 3.56
HSF4-220ENST00000522295 IFT140Q96RY7 1462 aa37.31■■■■□ 3.56
HSF4-220ENST00000522295 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.3■■■■□ 3.56
HSF4-220ENST00000522295 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.3■■■■□ 3.56
HSF4-220ENST00000522295 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.24■■■■□ 3.55
HSF4-220ENST00000522295 SOGA1O94964 1423 aa37.21■■■■□ 3.55
HSF4-220ENST00000522295 WDR97A6NE52 1622 aa37.1■■■■□ 3.53
HSF4-220ENST00000522295 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.07■■■■□ 3.52
HSF4-220ENST00000522295 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.05■■■■□ 3.522e-7■■■■■ 28.9
HSF4-220ENST00000522295 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.02■■■■□ 3.52
HSF4-220ENST00000522295 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37■■■■□ 3.51
HSF4-220ENST00000522295 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.87■■■■□ 3.49
HSF4-220ENST00000522295 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.8■■■■□ 3.48
HSF4-220ENST00000522295 PBRM1Q86U86 1689 aa36.75■■■■□ 3.47
HSF4-220ENST00000522295 TRIM41Q8WV44 630 aa36.73■■■■□ 3.47
HSF4-220ENST00000522295 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.73■■■■□ 3.47
HSF4-220ENST00000522295 GRIN2BQ13224 1484 aa36.71■■■■□ 3.47
HSF4-220ENST00000522295 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.68■■■■□ 3.46
HSF4-220ENST00000522295 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.64■■■■□ 3.46
HSF4-220ENST00000522295 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.57■■■■□ 3.44
HSF4-220ENST00000522295 CHD1O14646 1710 aa36.56■■■■□ 3.44
HSF4-220ENST00000522295 KIF27Q86VH2 1401 aa36.55■■■■□ 3.44
HSF4-220ENST00000522295 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.54■■■■□ 3.44
HSF4-220ENST00000522295 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.53■■■■□ 3.44
HSF4-220ENST00000522295 ADAMTS12P58397 1594 aa36.48■■■■□ 3.43
HSF4-220ENST00000522295 SYNJ2O15056 1496 aa36.45■■■■□ 3.42
HSF4-220ENST00000522295 IGF1RP08069 1367 aa36.45■■■■□ 3.42
HSF4-220ENST00000522295 FBLN2P98095 1184 aa36.43■■■■□ 3.42
HSF4-220ENST00000522295 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.36■■■■□ 3.41
HSF4-220ENST00000522295 OSCARQ8IYS5 282 aa36.35■■■■□ 3.41
HSF4-220ENST00000522295 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
HSF4-220ENST00000522295 GRIN2AQ12879 1464 aa36.29■■■■□ 3.4
HSF4-220ENST00000522295 CUL7Q14999 1698 aa36.26■■■■□ 3.4
HSF4-220ENST00000522295 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.2■■■■□ 3.39
HSF4-220ENST00000522295 CEP170Q5SW79 1584 aa36.16■■■■□ 3.38
HSF4-220ENST00000522295 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.14■■■■□ 3.38
HSF4-220ENST00000522295 NUP160Q12769 1436 aa36.12■■■■□ 3.37
HSF4-220ENST00000522295 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.36
HSF4-220ENST00000522295 EEA1Q15075 1411 aa36.03■■■■□ 3.36
HSF4-220ENST00000522295 PRXQ9BXM0 1461 aa36.03■■■■□ 3.36
HSF4-220ENST00000522295 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.03■■■■□ 3.36
HSF4-220ENST00000522295 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.01■■■■□ 3.35
HSF4-220ENST00000522295 ARHGEF11O15085 1522 aa35.87■■■■□ 3.33
HSF4-220ENST00000522295 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.86■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms