RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592175.5

KDM4B-210, Transcript of lysine demethylase 4B, humanhuman

TSL 4

Gene KDM4B, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4B-210ENST00000592175 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.04■■■■■ 4
KDM4B-210ENST00000592175 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.72■■■■□ 3.31
KDM4B-210ENST00000592175 ABCC9O60706 1549 aa35.15■■■■□ 3.22
KDM4B-210ENST00000592175 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.77■■■■□ 3
KDM4B-210ENST00000592175 NACADO15069 1562 aa33.68■■■□□ 2.98
KDM4B-210ENST00000592175 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.52■■■□□ 2.96
KDM4B-210ENST00000592175 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.45■■■□□ 2.95
KDM4B-210ENST00000592175 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.3■■■□□ 2.92
KDM4B-210ENST00000592175 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.18■■■□□ 2.9
KDM4B-210ENST00000592175 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.87■■■□□ 2.85
KDM4B-210ENST00000592175 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.79■■■□□ 2.84
KDM4B-210ENST00000592175 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.68■■■□□ 2.82
KDM4B-210ENST00000592175 SCRIBQ14160 1630 aa32.5■■■□□ 2.79
KDM4B-210ENST00000592175 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.48■■■□□ 2.79
KDM4B-210ENST00000592175 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.47■■■□□ 2.79
KDM4B-210ENST00000592175 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.88■■■□□ 2.69
KDM4B-210ENST00000592175 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.79■■■□□ 2.68
KDM4B-210ENST00000592175 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.65■■■□□ 2.66
KDM4B-210ENST00000592175 SMARCA4P51532 1647 aa31.1■■■□□ 2.57
KDM4B-210ENST00000592175 NCAPD3P42695 1498 aa31.09■■■□□ 2.57
KDM4B-210ENST00000592175 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
KDM4B-210ENST00000592175 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.02■■■□□ 2.56
KDM4B-210ENST00000592175 SMARCA2P51531 1590 aa31.02■■■□□ 2.56
KDM4B-210ENST00000592175 HMGXB3Q12766 1538 aa30.9■■■□□ 2.54
KDM4B-210ENST00000592175 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.85■■■□□ 2.53
KDM4B-210ENST00000592175 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.81■■■□□ 2.52
KDM4B-210ENST00000592175 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.52
KDM4B-210ENST00000592175 WIZO95785 1651 aa30.42■■■□□ 2.46
KDM4B-210ENST00000592175 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
KDM4B-210ENST00000592175 ERCC6Q03468 1493 aa30.38■■■□□ 2.45
KDM4B-210ENST00000592175 NESP48681 1621 aa30.31■■■□□ 2.44
KDM4B-210ENST00000592175 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.3■■■□□ 2.44
KDM4B-210ENST00000592175 CUX2O14529 1486 aa30.19■■■□□ 2.42
KDM4B-210ENST00000592175 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
KDM4B-210ENST00000592175 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.16■■■□□ 2.42
KDM4B-210ENST00000592175 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.13■■■□□ 2.41
KDM4B-210ENST00000592175 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.94■■■□□ 2.38
KDM4B-210ENST00000592175 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
KDM4B-210ENST00000592175 CFTRP13569 1480 aa29.93■■■□□ 2.38
KDM4B-210ENST00000592175 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.8■■■□□ 2.36
KDM4B-210ENST00000592175 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.79■■■□□ 2.36
KDM4B-210ENST00000592175 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.79■■■□□ 2.36
KDM4B-210ENST00000592175 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.79■■■□□ 2.36
KDM4B-210ENST00000592175 WDR62O43379 1518 aa29.7■■■□□ 2.34
KDM4B-210ENST00000592175 PRDM2Q13029 1718 aa29.6■■■□□ 2.33
KDM4B-210ENST00000592175 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.55■■■□□ 2.32
KDM4B-210ENST00000592175 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
KDM4B-210ENST00000592175 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
KDM4B-210ENST00000592175 ABCC8Q09428 1581 aa29.35■■■□□ 2.29
KDM4B-210ENST00000592175 TOPBP1Q92547 1522 aa29.27■■■□□ 2.28
KDM4B-210ENST00000592175 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.22■■■□□ 2.27
KDM4B-210ENST00000592175 IFT140Q96RY7 1462 aa29.2■■■□□ 2.26
KDM4B-210ENST00000592175 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
KDM4B-210ENST00000592175 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
KDM4B-210ENST00000592175 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
KDM4B-210ENST00000592175 CUX1P39880 1505 aa28.93■■■□□ 2.22
KDM4B-210ENST00000592175 SOGA1O94964 1423 aa28.9■■■□□ 2.22
KDM4B-210ENST00000592175 OSCARQ8IYS5 282 aa28.9■■■□□ 2.22
KDM4B-210ENST00000592175 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
KDM4B-210ENST00000592175 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.88■■■□□ 2.21
KDM4B-210ENST00000592175 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.84■■■□□ 2.21
KDM4B-210ENST00000592175 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.83■■■□□ 2.212e-8■■■■■ 32.2
KDM4B-210ENST00000592175 WDR97A6NE52 1622 aa28.8■■■□□ 2.2
KDM4B-210ENST00000592175 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
KDM4B-210ENST00000592175 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.69■■■□□ 2.185e-6■■■■■ 54.3
KDM4B-210ENST00000592175 TOP2BQ02880 1626 aa28.64■■■□□ 2.18
KDM4B-210ENST00000592175 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.64■■■□□ 2.17
KDM4B-210ENST00000592175 GRIN2BQ13224 1484 aa28.62■■■□□ 2.17
KDM4B-210ENST00000592175 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.61■■■□□ 2.17
KDM4B-210ENST00000592175 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
KDM4B-210ENST00000592175 SYNJ1O43426 1573 aa28.56■■■□□ 2.16
KDM4B-210ENST00000592175 FBLN2P98095 1184 aa28.56■■■□□ 2.16
KDM4B-210ENST00000592175 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.56■■■□□ 2.16
KDM4B-210ENST00000592175 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.56■■■□□ 2.16
KDM4B-210ENST00000592175 CHD1O14646 1710 aa28.54■■■□□ 2.16
KDM4B-210ENST00000592175 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.5■■■□□ 2.15
KDM4B-210ENST00000592175 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
KDM4B-210ENST00000592175 SYNJ2O15056 1496 aa28.46■■■□□ 2.15
KDM4B-210ENST00000592175 PBRM1Q86U86 1689 aa28.45■■■□□ 2.14
KDM4B-210ENST00000592175 TRIM41Q8WV44 630 aa28.39■■■□□ 2.14
KDM4B-210ENST00000592175 ARHGEF11O15085 1522 aa28.37■■■□□ 2.13
KDM4B-210ENST00000592175 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.36■■■□□ 2.13
KDM4B-210ENST00000592175 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.36■■■□□ 2.13
KDM4B-210ENST00000592175 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.36■■■□□ 2.13
KDM4B-210ENST00000592175 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.3■■■□□ 2.12
KDM4B-210ENST00000592175 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.28■■■□□ 2.12
KDM4B-210ENST00000592175 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.25■■■□□ 2.11
KDM4B-210ENST00000592175 ADAMTS12P58397 1594 aa28.24■■■□□ 2.11
KDM4B-210ENST00000592175 GRIN2AQ12879 1464 aa28.22■■■□□ 2.11
KDM4B-210ENST00000592175 KIF27Q86VH2 1401 aa28.14■■■□□ 2.1
KDM4B-210ENST00000592175 NUP160Q12769 1436 aa28.12■■■□□ 2.09
KDM4B-210ENST00000592175 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.12■■■□□ 2.09
KDM4B-210ENST00000592175 ARAP1Q96P48 1450 aa28.1■■■□□ 2.09
KDM4B-210ENST00000592175 CEP170Q5SW79 1584 aa28.04■■■□□ 2.08
KDM4B-210ENST00000592175 IGF1RP08069 1367 aa28.03■■■□□ 2.08
KDM4B-210ENST00000592175 CUL7Q14999 1698 aa27.97■■■□□ 2.07
KDM4B-210ENST00000592175 SHROOM2Q13796 1616 aa27.91■■■□□ 2.06
KDM4B-210ENST00000592175 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.86■■■□□ 2.05
KDM4B-210ENST00000592175 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.83■■■□□ 2.05
KDM4B-210ENST00000592175 JPH4Q96JJ6 628 aa27.83■■■□□ 2.05
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