RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522870.5

HSF4-222, Transcript of heat shock transcription factor 4, humanhuman

TSL 5

Gene HSF4, Length 1,599 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF4-222ENST00000522870 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.75■■■■■ 6.35
HSF4-222ENST00000522870 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.7■■■■■ 5.39
HSF4-222ENST00000522870 ABCC9O60706 1549 aa48.08■■■■■ 5.29
HSF4-222ENST00000522870 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.05■■■■■ 4.96
HSF4-222ENST00000522870 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.01■■■■■ 4.96
HSF4-222ENST00000522870 NACADO15069 1562 aa45.93■■■■■ 4.94
HSF4-222ENST00000522870 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.56■■■■■ 4.88
HSF4-222ENST00000522870 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.53■■■■■ 4.88
HSF4-222ENST00000522870 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.25■■■■■ 4.83
HSF4-222ENST00000522870 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.94■■■■■ 4.796e-10■■■□□ 19.1
HSF4-222ENST00000522870 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.89■■■■■ 4.78
HSF4-222ENST00000522870 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.67■■■■■ 4.74
HSF4-222ENST00000522870 SCRIBQ14160 1630 aa44.49■■■■■ 4.71
HSF4-222ENST00000522870 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.47■■■■■ 4.71
HSF4-222ENST00000522870 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.16■■■■■ 4.66
HSF4-222ENST00000522870 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.53■■■■■ 4.56
HSF4-222ENST00000522870 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.42■■■■■ 4.54
HSF4-222ENST00000522870 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.24■■■■■ 4.51
HSF4-222ENST00000522870 SMARCA4P51532 1647 aa42.5■■■■■ 4.39
HSF4-222ENST00000522870 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.44■■■■■ 4.38
HSF4-222ENST00000522870 NCAPD3P42695 1498 aa42.43■■■■■ 4.38
HSF4-222ENST00000522870 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.41■■■■■ 4.38
HSF4-222ENST00000522870 SMARCA2P51531 1590 aa42.3■■■■■ 4.36
HSF4-222ENST00000522870 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.2■■■■■ 4.35
HSF4-222ENST00000522870 HMGXB3Q12766 1538 aa42.14■■■■■ 4.34
HSF4-222ENST00000522870 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.09■■■■■ 4.33
HSF4-222ENST00000522870 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.03■■■■■ 4.32
HSF4-222ENST00000522870 WIZO95785 1651 aa41.69■■■■■ 4.26
HSF4-222ENST00000522870 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.64■■■■■ 4.26
HSF4-222ENST00000522870 NESP48681 1621 aa41.51■■■■■ 4.24
HSF4-222ENST00000522870 ERCC6Q03468 1493 aa41.47■■■■■ 4.23
HSF4-222ENST00000522870 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.3■■■■■ 4.2
HSF4-222ENST00000522870 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.24■■■■■ 4.19
HSF4-222ENST00000522870 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.21■■■■■ 4.19
HSF4-222ENST00000522870 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.11■■■■■ 4.17
HSF4-222ENST00000522870 CUX2O14529 1486 aa41.1■■■■■ 4.17
HSF4-222ENST00000522870 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.9■■■■■ 4.14
HSF4-222ENST00000522870 CFTRP13569 1480 aa40.87■■■■■ 4.13
HSF4-222ENST00000522870 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
HSF4-222ENST00000522870 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.8■■■■■ 4.12
HSF4-222ENST00000522870 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.71■■■■■ 4.11
HSF4-222ENST00000522870 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.68■■■■■ 4.1
HSF4-222ENST00000522870 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.67■■■■■ 4.1
HSF4-222ENST00000522870 WDR62O43379 1518 aa40.52■■■■■ 4.08
HSF4-222ENST00000522870 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.44■■■■■ 4.06
HSF4-222ENST00000522870 PRDM2Q13029 1718 aa40.36■■■■■ 4.05
HSF4-222ENST00000522870 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.31■■■■■ 4.04
HSF4-222ENST00000522870 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.28■■■■■ 4.04
HSF4-222ENST00000522870 TOPBP1Q92547 1522 aa40.01■■■■■ 4
HSF4-222ENST00000522870 ABCC8Q09428 1581 aa39.99■■■■□ 3.99
HSF4-222ENST00000522870 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.91■■■■□ 3.98
HSF4-222ENST00000522870 IFT140Q96RY7 1462 aa39.84■■■■□ 3.97
HSF4-222ENST00000522870 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.71■■■■□ 3.95
HSF4-222ENST00000522870 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.66■■■■□ 3.94
HSF4-222ENST00000522870 CUX1P39880 1505 aa39.59■■■■□ 3.93
HSF4-222ENST00000522870 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.55■■■■□ 3.92
HSF4-222ENST00000522870 SOGA1O94964 1423 aa39.53■■■■□ 3.92
HSF4-222ENST00000522870 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.52■■■■□ 3.92
HSF4-222ENST00000522870 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.52■■■■□ 3.92
HSF4-222ENST00000522870 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.47■■■■□ 3.912e-7■■■■■ 28.9
HSF4-222ENST00000522870 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.46■■■■□ 3.91
HSF4-222ENST00000522870 OSCARQ8IYS5 282 aa39.44■■■■□ 3.9
HSF4-222ENST00000522870 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.37■■■■□ 3.89
HSF4-222ENST00000522870 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.26■■■■□ 3.88
HSF4-222ENST00000522870 WDR97A6NE52 1622 aa39.2■■■■□ 3.87
HSF4-222ENST00000522870 TOP2BQ02880 1626 aa39.15■■■■□ 3.86
HSF4-222ENST00000522870 SYNJ1O43426 1573 aa39.13■■■■□ 3.85
HSF4-222ENST00000522870 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.12■■■■□ 3.85
HSF4-222ENST00000522870 FBLN2P98095 1184 aa39.11■■■■□ 3.85
HSF4-222ENST00000522870 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.1■■■■□ 3.85
HSF4-222ENST00000522870 GRIN2BQ13224 1484 aa39.07■■■■□ 3.85
HSF4-222ENST00000522870 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.06■■■■□ 3.84
HSF4-222ENST00000522870 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.04■■■■□ 3.84
HSF4-222ENST00000522870 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.98■■■■□ 3.83
HSF4-222ENST00000522870 CHD1O14646 1710 aa38.98■■■■□ 3.83
HSF4-222ENST00000522870 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.94■■■■□ 3.82
HSF4-222ENST00000522870 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.94■■■■□ 3.82
HSF4-222ENST00000522870 PBRM1Q86U86 1689 aa38.85■■■■□ 3.81
HSF4-222ENST00000522870 SYNJ2O15056 1496 aa38.85■■■■□ 3.81
HSF4-222ENST00000522870 TRIM41Q8WV44 630 aa38.84■■■■□ 3.81
HSF4-222ENST00000522870 ARHGEF11O15085 1522 aa38.72■■■■□ 3.79
HSF4-222ENST00000522870 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.71■■■■□ 3.79
HSF4-222ENST00000522870 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.71■■■■□ 3.79
HSF4-222ENST00000522870 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.71■■■■□ 3.79
HSF4-222ENST00000522870 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.63■■■■□ 3.77
HSF4-222ENST00000522870 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.61■■■■□ 3.77
HSF4-222ENST00000522870 ADAMTS12P58397 1594 aa38.59■■■■□ 3.77
HSF4-222ENST00000522870 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.59■■■■□ 3.77
HSF4-222ENST00000522870 GRIN2AQ12879 1464 aa38.56■■■■□ 3.76
HSF4-222ENST00000522870 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.48■■■■□ 3.75
HSF4-222ENST00000522870 KIF27Q86VH2 1401 aa38.48■■■■□ 3.75
HSF4-222ENST00000522870 NUP160Q12769 1436 aa38.41■■■■□ 3.74
HSF4-222ENST00000522870 ARAP1Q96P48 1450 aa38.4■■■■□ 3.74
HSF4-222ENST00000522870 IGF1RP08069 1367 aa38.39■■■■□ 3.74
HSF4-222ENST00000522870 CEP170Q5SW79 1584 aa38.35■■■■□ 3.73
HSF4-222ENST00000522870 CUL7Q14999 1698 aa38.17■■■■□ 3.7
HSF4-222ENST00000522870 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.14■■■■□ 3.7
HSF4-222ENST00000522870 JPH4Q96JJ6 628 aa38.09■■■■□ 3.69
HSF4-222ENST00000522870 SHROOM2Q13796 1616 aa38.08■■■■□ 3.69
HSF4-222ENST00000522870 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.08■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms