Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL11Q9NVR0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL11Q9NVR0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHL11Q9NVR0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHL11Q9NVR0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
KLHL11Q9NVR0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL11Q9NVR0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL11Q9NVR0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL11Q9NVR0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL11Q9NVR0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL11Q9NVR0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL11Q9NVR0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL11Q9NVR0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL11Q9NVR0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL11Q9NVR0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL11Q9NVR0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL11Q9NVR0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL11Q9NVR0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL11Q9NVR0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL11Q9NVR0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL11Q9NVR0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHL11Q9NVR0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHL11Q9NVR0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHL11Q9NVR0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL11Q9NVR0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL11Q9NVR0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL11Q9NVR0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL11Q9NVR0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL11Q9NVR0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL11Q9NVR0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL11Q9NVR0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL11Q9NVR0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL11Q9NVR0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL11Q9NVR0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHL11Q9NVR0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHL11Q9NVR0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHL11Q9NVR0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHL11Q9NVR0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHL11Q9NVR0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHL11Q9NVR0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHL11Q9NVR0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHL11Q9NVR0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHL11Q9NVR0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHL11Q9NVR0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL11Q9NVR0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL11Q9NVR0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL11Q9NVR0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL11Q9NVR0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL11Q9NVR0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL11Q9NVR0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL11Q9NVR0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL11Q9NVR0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL11Q9NVR0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL11Q9NVR0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL11Q9NVR0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL11Q9NVR0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL11Q9NVR0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL11Q9NVR0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL11Q9NVR0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL11Q9NVR0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
KLHL11Q9NVR0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KLHL11Q9NVR0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL11Q9NVR0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL11Q9NVR0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL11Q9NVR0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL11Q9NVR0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL11Q9NVR0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL11Q9NVR0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL11Q9NVR0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL11Q9NVR0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL11Q9NVR0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL11Q9NVR0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL11Q9NVR0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL11Q9NVR0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL11Q9NVR0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL11Q9NVR0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL11Q9NVR0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL11Q9NVR0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL11Q9NVR0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL11Q9NVR0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL11Q9NVR0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL11Q9NVR0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL11Q9NVR0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL11Q9NVR0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL11Q9NVR0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL11Q9NVR0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL11Q9NVR0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL11Q9NVR0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL11Q9NVR0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL11Q9NVR0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL11Q9NVR0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL11Q9NVR0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL11Q9NVR0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL11Q9NVR0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL11Q9NVR0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL11Q9NVR0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL11Q9NVR0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL11Q9NVR0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL11Q9NVR0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHL11Q9NVR0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms