Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNPLA3Q9NST1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNPLA3Q9NST1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNPLA3Q9NST1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNPLA3Q9NST1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNPLA3Q9NST1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNPLA3Q9NST1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNPLA3Q9NST1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNPLA3Q9NST1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PNPLA3Q9NST1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNPLA3Q9NST1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNPLA3Q9NST1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PNPLA3Q9NST1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PNPLA3Q9NST1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNPLA3Q9NST1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNPLA3Q9NST1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNPLA3Q9NST1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PNPLA3Q9NST1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PNPLA3Q9NST1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNPLA3Q9NST1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNPLA3Q9NST1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNPLA3Q9NST1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNPLA3Q9NST1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNPLA3Q9NST1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNPLA3Q9NST1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNPLA3Q9NST1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNPLA3Q9NST1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNPLA3Q9NST1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNPLA3Q9NST1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNPLA3Q9NST1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNPLA3Q9NST1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNPLA3Q9NST1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNPLA3Q9NST1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PNPLA3Q9NST1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNPLA3Q9NST1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNPLA3Q9NST1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNPLA3Q9NST1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNPLA3Q9NST1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PNPLA3Q9NST1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PNPLA3Q9NST1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNPLA3Q9NST1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PNPLA3Q9NST1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PNPLA3Q9NST1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNPLA3Q9NST1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNPLA3Q9NST1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNPLA3Q9NST1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNPLA3Q9NST1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNPLA3Q9NST1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNPLA3Q9NST1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNPLA3Q9NST1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNPLA3Q9NST1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNPLA3Q9NST1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNPLA3Q9NST1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNPLA3Q9NST1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNPLA3Q9NST1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNPLA3Q9NST1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNPLA3Q9NST1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNPLA3Q9NST1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNPLA3Q9NST1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PNPLA3Q9NST1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNPLA3Q9NST1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNPLA3Q9NST1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PNPLA3Q9NST1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNPLA3Q9NST1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNPLA3Q9NST1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PNPLA3Q9NST1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PNPLA3Q9NST1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNPLA3Q9NST1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNPLA3Q9NST1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNPLA3Q9NST1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PNPLA3Q9NST1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNPLA3Q9NST1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNPLA3Q9NST1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PNPLA3Q9NST1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNPLA3Q9NST1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNPLA3Q9NST1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNPLA3Q9NST1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNPLA3Q9NST1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNPLA3Q9NST1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNPLA3Q9NST1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNPLA3Q9NST1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNPLA3Q9NST1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNPLA3Q9NST1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNPLA3Q9NST1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNPLA3Q9NST1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNPLA3Q9NST1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNPLA3Q9NST1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNPLA3Q9NST1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNPLA3Q9NST1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNPLA3Q9NST1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNPLA3Q9NST1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNPLA3Q9NST1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNPLA3Q9NST1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNPLA3Q9NST1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNPLA3Q9NST1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNPLA3Q9NST1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PNPLA3Q9NST1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PNPLA3Q9NST1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNPLA3Q9NST1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNPLA3Q9NST1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms