Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF275Q9NSD4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF275Q9NSD4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF275Q9NSD4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF275Q9NSD4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF275Q9NSD4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF275Q9NSD4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF275Q9NSD4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF275Q9NSD4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF275Q9NSD4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF275Q9NSD4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF275Q9NSD4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF275Q9NSD4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF275Q9NSD4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF275Q9NSD4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF275Q9NSD4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF275Q9NSD4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF275Q9NSD4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF275Q9NSD4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF275Q9NSD4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF275Q9NSD4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF275Q9NSD4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF275Q9NSD4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF275Q9NSD4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF275Q9NSD4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF275Q9NSD4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF275Q9NSD4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF275Q9NSD4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF275Q9NSD4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZNF275Q9NSD4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZNF275Q9NSD4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF275Q9NSD4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF275Q9NSD4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF275Q9NSD4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF275Q9NSD4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF275Q9NSD4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF275Q9NSD4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF275Q9NSD4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF275Q9NSD4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF275Q9NSD4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF275Q9NSD4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF275Q9NSD4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF275Q9NSD4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF275Q9NSD4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF275Q9NSD4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF275Q9NSD4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF275Q9NSD4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF275Q9NSD4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF275Q9NSD4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF275Q9NSD4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF275Q9NSD4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF275Q9NSD4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF275Q9NSD4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF275Q9NSD4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF275Q9NSD4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF275Q9NSD4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF275Q9NSD4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF275Q9NSD4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF275Q9NSD4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF275Q9NSD4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF275Q9NSD4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF275Q9NSD4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF275Q9NSD4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms