Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR46

SH3GLB2, Endophilin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GLB2Q9NR46 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SH3GLB2Q9NR46 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SH3GLB2Q9NR46 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SH3GLB2Q9NR46 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SH3GLB2Q9NR46 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SH3GLB2Q9NR46 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SH3GLB2Q9NR46 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SH3GLB2Q9NR46 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SH3GLB2Q9NR46 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SH3GLB2Q9NR46 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SH3GLB2Q9NR46 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SH3GLB2Q9NR46 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SH3GLB2Q9NR46 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SH3GLB2Q9NR46 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SH3GLB2Q9NR46 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SH3GLB2Q9NR46 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SH3GLB2Q9NR46 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SH3GLB2Q9NR46 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SH3GLB2Q9NR46 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SH3GLB2Q9NR46 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SH3GLB2Q9NR46 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SH3GLB2Q9NR46 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SH3GLB2Q9NR46 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SH3GLB2Q9NR46 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SH3GLB2Q9NR46 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SH3GLB2Q9NR46 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SH3GLB2Q9NR46 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SH3GLB2Q9NR46 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SH3GLB2Q9NR46 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SH3GLB2Q9NR46 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SH3GLB2Q9NR46 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SH3GLB2Q9NR46 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SH3GLB2Q9NR46 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SH3GLB2Q9NR46 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SH3GLB2Q9NR46 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SH3GLB2Q9NR46 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SH3GLB2Q9NR46 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SH3GLB2Q9NR46 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SH3GLB2Q9NR46 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SH3GLB2Q9NR46 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SH3GLB2Q9NR46 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SH3GLB2Q9NR46 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SH3GLB2Q9NR46 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SH3GLB2Q9NR46 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SH3GLB2Q9NR46 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SH3GLB2Q9NR46 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SH3GLB2Q9NR46 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SH3GLB2Q9NR46 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SH3GLB2Q9NR46 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SH3GLB2Q9NR46 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SH3GLB2Q9NR46 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SH3GLB2Q9NR46 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SH3GLB2Q9NR46 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SH3GLB2Q9NR46 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SH3GLB2Q9NR46 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SH3GLB2Q9NR46 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SH3GLB2Q9NR46 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SH3GLB2Q9NR46 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SH3GLB2Q9NR46 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SH3GLB2Q9NR46 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SH3GLB2Q9NR46 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SH3GLB2Q9NR46 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SH3GLB2Q9NR46 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SH3GLB2Q9NR46 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SH3GLB2Q9NR46 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SH3GLB2Q9NR46 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SH3GLB2Q9NR46 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SH3GLB2Q9NR46 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SH3GLB2Q9NR46 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SH3GLB2Q9NR46 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SH3GLB2Q9NR46 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SH3GLB2Q9NR46 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SH3GLB2Q9NR46 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SH3GLB2Q9NR46 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SH3GLB2Q9NR46 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SH3GLB2Q9NR46 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SH3GLB2Q9NR46 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SH3GLB2Q9NR46 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SH3GLB2Q9NR46 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SH3GLB2Q9NR46 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SH3GLB2Q9NR46 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SH3GLB2Q9NR46 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SH3GLB2Q9NR46 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SH3GLB2Q9NR46 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SH3GLB2Q9NR46 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SH3GLB2Q9NR46 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SH3GLB2Q9NR46 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SH3GLB2Q9NR46 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SH3GLB2Q9NR46 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SH3GLB2Q9NR46 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SH3GLB2Q9NR46 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SH3GLB2Q9NR46 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SH3GLB2Q9NR46 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SH3GLB2Q9NR46 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SH3GLB2Q9NR46 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SH3GLB2Q9NR46 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SH3GLB2Q9NR46 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SH3GLB2Q9NR46 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SH3GLB2Q9NR46 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SH3GLB2Q9NR46 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms