Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPY3

CD93, Complement component C1q receptor, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD93Q9NPY3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CD93Q9NPY3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CD93Q9NPY3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CD93Q9NPY3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CD93Q9NPY3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CD93Q9NPY3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CD93Q9NPY3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CD93Q9NPY3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CD93Q9NPY3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CD93Q9NPY3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CD93Q9NPY3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CD93Q9NPY3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CD93Q9NPY3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CD93Q9NPY3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CD93Q9NPY3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CD93Q9NPY3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CD93Q9NPY3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CD93Q9NPY3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CD93Q9NPY3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CD93Q9NPY3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CD93Q9NPY3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CD93Q9NPY3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CD93Q9NPY3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CD93Q9NPY3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CD93Q9NPY3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CD93Q9NPY3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CD93Q9NPY3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CD93Q9NPY3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CD93Q9NPY3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CD93Q9NPY3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD93Q9NPY3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD93Q9NPY3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD93Q9NPY3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD93Q9NPY3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD93Q9NPY3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD93Q9NPY3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD93Q9NPY3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD93Q9NPY3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CD93Q9NPY3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CD93Q9NPY3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CD93Q9NPY3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CD93Q9NPY3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CD93Q9NPY3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CD93Q9NPY3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CD93Q9NPY3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CD93Q9NPY3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CD93Q9NPY3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CD93Q9NPY3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CD93Q9NPY3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CD93Q9NPY3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD93Q9NPY3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD93Q9NPY3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD93Q9NPY3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD93Q9NPY3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD93Q9NPY3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD93Q9NPY3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CD93Q9NPY3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD93Q9NPY3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD93Q9NPY3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD93Q9NPY3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD93Q9NPY3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD93Q9NPY3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD93Q9NPY3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CD93Q9NPY3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CD93Q9NPY3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CD93Q9NPY3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CD93Q9NPY3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CD93Q9NPY3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD93Q9NPY3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD93Q9NPY3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CD93Q9NPY3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CD93Q9NPY3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CD93Q9NPY3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CD93Q9NPY3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CD93Q9NPY3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD93Q9NPY3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD93Q9NPY3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD93Q9NPY3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CD93Q9NPY3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CD93Q9NPY3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD93Q9NPY3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD93Q9NPY3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CD93Q9NPY3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD93Q9NPY3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD93Q9NPY3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD93Q9NPY3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD93Q9NPY3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD93Q9NPY3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD93Q9NPY3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD93Q9NPY3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD93Q9NPY3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD93Q9NPY3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD93Q9NPY3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD93Q9NPY3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD93Q9NPY3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD93Q9NPY3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD93Q9NPY3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD93Q9NPY3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD93Q9NPY3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD93Q9NPY3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms