Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC6A20Q9NP91 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC6A20Q9NP91 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC6A20Q9NP91 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC6A20Q9NP91 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC6A20Q9NP91 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC6A20Q9NP91 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC6A20Q9NP91 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC6A20Q9NP91 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC6A20Q9NP91 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC6A20Q9NP91 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC6A20Q9NP91 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC6A20Q9NP91 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC6A20Q9NP91 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC6A20Q9NP91 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A20Q9NP91 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A20Q9NP91 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A20Q9NP91 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A20Q9NP91 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A20Q9NP91 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A20Q9NP91 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC6A20Q9NP91 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC6A20Q9NP91 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC6A20Q9NP91 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC6A20Q9NP91 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC6A20Q9NP91 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A20Q9NP91 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A20Q9NP91 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A20Q9NP91 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A20Q9NP91 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A20Q9NP91 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A20Q9NP91 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A20Q9NP91 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A20Q9NP91 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC6A20Q9NP91 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC6A20Q9NP91 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC6A20Q9NP91 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A20Q9NP91 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A20Q9NP91 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC6A20Q9NP91 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC6A20Q9NP91 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC6A20Q9NP91 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC6A20Q9NP91 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC6A20Q9NP91 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC6A20Q9NP91 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A20Q9NP91 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A20Q9NP91 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A20Q9NP91 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A20Q9NP91 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A20Q9NP91 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A20Q9NP91 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A20Q9NP91 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A20Q9NP91 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A20Q9NP91 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A20Q9NP91 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A20Q9NP91 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A20Q9NP91 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A20Q9NP91 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A20Q9NP91 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A20Q9NP91 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A20Q9NP91 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A20Q9NP91 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A20Q9NP91 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A20Q9NP91 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A20Q9NP91 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC6A20Q9NP91 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A20Q9NP91 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A20Q9NP91 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A20Q9NP91 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A20Q9NP91 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC6A20Q9NP91 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC6A20Q9NP91 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC6A20Q9NP91 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC6A20Q9NP91 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC6A20Q9NP91 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC6A20Q9NP91 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC6A20Q9NP91 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC6A20Q9NP91 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC6A20Q9NP91 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC6A20Q9NP91 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC6A20Q9NP91 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC6A20Q9NP91 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC6A20Q9NP91 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC6A20Q9NP91 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC6A20Q9NP91 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC6A20Q9NP91 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC6A20Q9NP91 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC6A20Q9NP91 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC6A20Q9NP91 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC6A20Q9NP91 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A20Q9NP91 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A20Q9NP91 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A20Q9NP91 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A20Q9NP91 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A20Q9NP91 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A20Q9NP91 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A20Q9NP91 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A20Q9NP91 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A20Q9NP91 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A20Q9NP91 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms