Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE7BQ9NP56 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE7BQ9NP56 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE7BQ9NP56 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE7BQ9NP56 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE7BQ9NP56 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE7BQ9NP56 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE7BQ9NP56 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE7BQ9NP56 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE7BQ9NP56 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE7BQ9NP56 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE7BQ9NP56 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE7BQ9NP56 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE7BQ9NP56 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE7BQ9NP56 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE7BQ9NP56 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE7BQ9NP56 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE7BQ9NP56 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE7BQ9NP56 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE7BQ9NP56 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE7BQ9NP56 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE7BQ9NP56 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE7BQ9NP56 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE7BQ9NP56 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE7BQ9NP56 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE7BQ9NP56 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE7BQ9NP56 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE7BQ9NP56 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE7BQ9NP56 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE7BQ9NP56 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE7BQ9NP56 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE7BQ9NP56 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE7BQ9NP56 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE7BQ9NP56 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE7BQ9NP56 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE7BQ9NP56 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE7BQ9NP56 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE7BQ9NP56 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE7BQ9NP56 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE7BQ9NP56 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE7BQ9NP56 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE7BQ9NP56 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE7BQ9NP56 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE7BQ9NP56 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE7BQ9NP56 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE7BQ9NP56 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE7BQ9NP56 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE7BQ9NP56 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE7BQ9NP56 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE7BQ9NP56 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE7BQ9NP56 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE7BQ9NP56 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE7BQ9NP56 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE7BQ9NP56 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE7BQ9NP56 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE7BQ9NP56 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE7BQ9NP56 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE7BQ9NP56 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE7BQ9NP56 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE7BQ9NP56 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDE7BQ9NP56 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
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