Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCCC2Q9HCC0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MCCC2Q9HCC0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCCC2Q9HCC0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCCC2Q9HCC0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCCC2Q9HCC0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCCC2Q9HCC0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCCC2Q9HCC0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCCC2Q9HCC0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCCC2Q9HCC0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCCC2Q9HCC0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCCC2Q9HCC0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCCC2Q9HCC0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCCC2Q9HCC0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCCC2Q9HCC0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCCC2Q9HCC0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCCC2Q9HCC0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCCC2Q9HCC0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCCC2Q9HCC0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCCC2Q9HCC0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCCC2Q9HCC0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MCCC2Q9HCC0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCCC2Q9HCC0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCCC2Q9HCC0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCCC2Q9HCC0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCCC2Q9HCC0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCCC2Q9HCC0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCCC2Q9HCC0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCCC2Q9HCC0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCCC2Q9HCC0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCCC2Q9HCC0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCCC2Q9HCC0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCCC2Q9HCC0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCCC2Q9HCC0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCCC2Q9HCC0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCCC2Q9HCC0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCCC2Q9HCC0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCCC2Q9HCC0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCCC2Q9HCC0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCCC2Q9HCC0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCCC2Q9HCC0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCCC2Q9HCC0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCCC2Q9HCC0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCCC2Q9HCC0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCCC2Q9HCC0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCCC2Q9HCC0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCCC2Q9HCC0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCCC2Q9HCC0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCCC2Q9HCC0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCCC2Q9HCC0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCCC2Q9HCC0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCCC2Q9HCC0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCCC2Q9HCC0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCCC2Q9HCC0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCCC2Q9HCC0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCCC2Q9HCC0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCCC2Q9HCC0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCCC2Q9HCC0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCCC2Q9HCC0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCCC2Q9HCC0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCCC2Q9HCC0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCCC2Q9HCC0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCCC2Q9HCC0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCCC2Q9HCC0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCCC2Q9HCC0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCCC2Q9HCC0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCCC2Q9HCC0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCCC2Q9HCC0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCCC2Q9HCC0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCCC2Q9HCC0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCCC2Q9HCC0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCCC2Q9HCC0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCC2Q9HCC0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCC2Q9HCC0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCC2Q9HCC0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCC2Q9HCC0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCC2Q9HCC0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCC2Q9HCC0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCC2Q9HCC0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCC2Q9HCC0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCC2Q9HCC0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCC2Q9HCC0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCC2Q9HCC0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCC2Q9HCC0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCC2Q9HCC0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCC2Q9HCC0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCC2Q9HCC0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCC2Q9HCC0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCC2Q9HCC0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCC2Q9HCC0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCC2Q9HCC0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCC2Q9HCC0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCC2Q9HCC0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCC2Q9HCC0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCC2Q9HCC0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCCC2Q9HCC0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MCCC2Q9HCC0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCCC2Q9HCC0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCCC2Q9HCC0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCCC2Q9HCC0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms