Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP29Q9HBJ7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP29Q9HBJ7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP29Q9HBJ7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP29Q9HBJ7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP29Q9HBJ7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP29Q9HBJ7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP29Q9HBJ7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
USP29Q9HBJ7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP29Q9HBJ7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP29Q9HBJ7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP29Q9HBJ7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP29Q9HBJ7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP29Q9HBJ7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP29Q9HBJ7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
USP29Q9HBJ7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP29Q9HBJ7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP29Q9HBJ7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP29Q9HBJ7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP29Q9HBJ7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP29Q9HBJ7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP29Q9HBJ7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP29Q9HBJ7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP29Q9HBJ7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP29Q9HBJ7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP29Q9HBJ7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP29Q9HBJ7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
USP29Q9HBJ7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP29Q9HBJ7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP29Q9HBJ7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP29Q9HBJ7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP29Q9HBJ7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP29Q9HBJ7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP29Q9HBJ7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP29Q9HBJ7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP29Q9HBJ7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP29Q9HBJ7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
USP29Q9HBJ7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
USP29Q9HBJ7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP29Q9HBJ7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP29Q9HBJ7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
USP29Q9HBJ7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP29Q9HBJ7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP29Q9HBJ7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP29Q9HBJ7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP29Q9HBJ7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP29Q9HBJ7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
USP29Q9HBJ7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP29Q9HBJ7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP29Q9HBJ7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP29Q9HBJ7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP29Q9HBJ7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP29Q9HBJ7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP29Q9HBJ7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP29Q9HBJ7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP29Q9HBJ7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP29Q9HBJ7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP29Q9HBJ7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP29Q9HBJ7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP29Q9HBJ7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP29Q9HBJ7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP29Q9HBJ7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP29Q9HBJ7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP29Q9HBJ7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP29Q9HBJ7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP29Q9HBJ7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
USP29Q9HBJ7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP29Q9HBJ7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP29Q9HBJ7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP29Q9HBJ7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP29Q9HBJ7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP29Q9HBJ7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP29Q9HBJ7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP29Q9HBJ7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP29Q9HBJ7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP29Q9HBJ7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP29Q9HBJ7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP29Q9HBJ7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP29Q9HBJ7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP29Q9HBJ7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP29Q9HBJ7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP29Q9HBJ7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP29Q9HBJ7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP29Q9HBJ7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP29Q9HBJ7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP29Q9HBJ7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26■■□□□ 1.75
USP29Q9HBJ7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26■■□□□ 1.75
USP29Q9HBJ7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP29Q9HBJ7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP29Q9HBJ7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP29Q9HBJ7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP29Q9HBJ7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP29Q9HBJ7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP29Q9HBJ7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP29Q9HBJ7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP29Q9HBJ7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP29Q9HBJ7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP29Q9HBJ7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP29Q9HBJ7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP29Q9HBJ7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms