Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB40

SCPEP1, Retinoid-inducible serine carboxypeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCPEP1Q9HB40 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCPEP1Q9HB40 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCPEP1Q9HB40 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCPEP1Q9HB40 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCPEP1Q9HB40 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SCPEP1Q9HB40 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCPEP1Q9HB40 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCPEP1Q9HB40 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCPEP1Q9HB40 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCPEP1Q9HB40 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCPEP1Q9HB40 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCPEP1Q9HB40 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCPEP1Q9HB40 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms