Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NXF3Q9H4D5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NXF3Q9H4D5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NXF3Q9H4D5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NXF3Q9H4D5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NXF3Q9H4D5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NXF3Q9H4D5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NXF3Q9H4D5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NXF3Q9H4D5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NXF3Q9H4D5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NXF3Q9H4D5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NXF3Q9H4D5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NXF3Q9H4D5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NXF3Q9H4D5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NXF3Q9H4D5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NXF3Q9H4D5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NXF3Q9H4D5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NXF3Q9H4D5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NXF3Q9H4D5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NXF3Q9H4D5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NXF3Q9H4D5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NXF3Q9H4D5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NXF3Q9H4D5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NXF3Q9H4D5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NXF3Q9H4D5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NXF3Q9H4D5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NXF3Q9H4D5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NXF3Q9H4D5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NXF3Q9H4D5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NXF3Q9H4D5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NXF3Q9H4D5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NXF3Q9H4D5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NXF3Q9H4D5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NXF3Q9H4D5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NXF3Q9H4D5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NXF3Q9H4D5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NXF3Q9H4D5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NXF3Q9H4D5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NXF3Q9H4D5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NXF3Q9H4D5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NXF3Q9H4D5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NXF3Q9H4D5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NXF3Q9H4D5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NXF3Q9H4D5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NXF3Q9H4D5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NXF3Q9H4D5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NXF3Q9H4D5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NXF3Q9H4D5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NXF3Q9H4D5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NXF3Q9H4D5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NXF3Q9H4D5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NXF3Q9H4D5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NXF3Q9H4D5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NXF3Q9H4D5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NXF3Q9H4D5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NXF3Q9H4D5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NXF3Q9H4D5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NXF3Q9H4D5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NXF3Q9H4D5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NXF3Q9H4D5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NXF3Q9H4D5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NXF3Q9H4D5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NXF3Q9H4D5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NXF3Q9H4D5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NXF3Q9H4D5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NXF3Q9H4D5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NXF3Q9H4D5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NXF3Q9H4D5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NXF3Q9H4D5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2
NXF3Q9H4D5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NXF3Q9H4D5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NXF3Q9H4D5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NXF3Q9H4D5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NXF3Q9H4D5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NXF3Q9H4D5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NXF3Q9H4D5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NXF3Q9H4D5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NXF3Q9H4D5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NXF3Q9H4D5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NXF3Q9H4D5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NXF3Q9H4D5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NXF3Q9H4D5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NXF3Q9H4D5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NXF3Q9H4D5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NXF3Q9H4D5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NXF3Q9H4D5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NXF3Q9H4D5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NXF3Q9H4D5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NXF3Q9H4D5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NXF3Q9H4D5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NXF3Q9H4D5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NXF3Q9H4D5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NXF3Q9H4D5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NXF3Q9H4D5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NXF3Q9H4D5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NXF3Q9H4D5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NXF3Q9H4D5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NXF3Q9H4D5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NXF3Q9H4D5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NXF3Q9H4D5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 204.9 ms