Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
EHD4Q9H223 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
EHD4Q9H223 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
EHD4Q9H223 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
EHD4Q9H223 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
EHD4Q9H223 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
EHD4Q9H223 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
EHD4Q9H223 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
EHD4Q9H223 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
EHD4Q9H223 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
EHD4Q9H223 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
EHD4Q9H223 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
EHD4Q9H223 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
EHD4Q9H223 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
EHD4Q9H223 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
EHD4Q9H223 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
EHD4Q9H223 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
EHD4Q9H223 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
EHD4Q9H223 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
EHD4Q9H223 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
EHD4Q9H223 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
EHD4Q9H223 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
EHD4Q9H223 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
EHD4Q9H223 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
EHD4Q9H223 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
EHD4Q9H223 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
EHD4Q9H223 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
EHD4Q9H223 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
EHD4Q9H223 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
EHD4Q9H223 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
EHD4Q9H223 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
EHD4Q9H223 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
EHD4Q9H223 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
EHD4Q9H223 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
EHD4Q9H223 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
EHD4Q9H223 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
EHD4Q9H223 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
EHD4Q9H223 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
EHD4Q9H223 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
EHD4Q9H223 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
EHD4Q9H223 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
EHD4Q9H223 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
EHD4Q9H223 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
EHD4Q9H223 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
EHD4Q9H223 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
EHD4Q9H223 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
EHD4Q9H223 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
EHD4Q9H223 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
EHD4Q9H223 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
EHD4Q9H223 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
EHD4Q9H223 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
EHD4Q9H223 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
EHD4Q9H223 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
EHD4Q9H223 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
EHD4Q9H223 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
EHD4Q9H223 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
EHD4Q9H223 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EHD4Q9H223 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EHD4Q9H223 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
EHD4Q9H223 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
EHD4Q9H223 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EHD4Q9H223 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EHD4Q9H223 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EHD4Q9H223 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EHD4Q9H223 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
EHD4Q9H223 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
EHD4Q9H223 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
EHD4Q9H223 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
EHD4Q9H223 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
EHD4Q9H223 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
EHD4Q9H223 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EHD4Q9H223 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EHD4Q9H223 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
EHD4Q9H223 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
EHD4Q9H223 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
EHD4Q9H223 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
EHD4Q9H223 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
EHD4Q9H223 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
EHD4Q9H223 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
EHD4Q9H223 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
EHD4Q9H223 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
EHD4Q9H223 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
EHD4Q9H223 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
EHD4Q9H223 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
EHD4Q9H223 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
EHD4Q9H223 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
EHD4Q9H223 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
EHD4Q9H223 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
EHD4Q9H223 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
EHD4Q9H223 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
EHD4Q9H223 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
EHD4Q9H223 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
EHD4Q9H223 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
EHD4Q9H223 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
EHD4Q9H223 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
EHD4Q9H223 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
EHD4Q9H223 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
EHD4Q9H223 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
EHD4Q9H223 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
EHD4Q9H223 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms