Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SDCBP2Q9H190 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SDCBP2Q9H190 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SDCBP2Q9H190 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SDCBP2Q9H190 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SDCBP2Q9H190 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SDCBP2Q9H190 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SDCBP2Q9H190 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SDCBP2Q9H190 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SDCBP2Q9H190 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SDCBP2Q9H190 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SDCBP2Q9H190 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SDCBP2Q9H190 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SDCBP2Q9H190 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SDCBP2Q9H190 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SDCBP2Q9H190 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SDCBP2Q9H190 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SDCBP2Q9H190 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SDCBP2Q9H190 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SDCBP2Q9H190 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SDCBP2Q9H190 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SDCBP2Q9H190 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SDCBP2Q9H190 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SDCBP2Q9H190 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SDCBP2Q9H190 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SDCBP2Q9H190 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SDCBP2Q9H190 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SDCBP2Q9H190 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SDCBP2Q9H190 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SDCBP2Q9H190 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SDCBP2Q9H190 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SDCBP2Q9H190 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SDCBP2Q9H190 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SDCBP2Q9H190 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SDCBP2Q9H190 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SDCBP2Q9H190 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SDCBP2Q9H190 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SDCBP2Q9H190 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SDCBP2Q9H190 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SDCBP2Q9H190 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SDCBP2Q9H190 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SDCBP2Q9H190 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SDCBP2Q9H190 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SDCBP2Q9H190 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SDCBP2Q9H190 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SDCBP2Q9H190 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SDCBP2Q9H190 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SDCBP2Q9H190 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SDCBP2Q9H190 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SDCBP2Q9H190 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SDCBP2Q9H190 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SDCBP2Q9H190 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SDCBP2Q9H190 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SDCBP2Q9H190 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SDCBP2Q9H190 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SDCBP2Q9H190 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SDCBP2Q9H190 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SDCBP2Q9H190 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SDCBP2Q9H190 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SDCBP2Q9H190 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SDCBP2Q9H190 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SDCBP2Q9H190 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SDCBP2Q9H190 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SDCBP2Q9H190 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SDCBP2Q9H190 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SDCBP2Q9H190 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SDCBP2Q9H190 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SDCBP2Q9H190 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SDCBP2Q9H190 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SDCBP2Q9H190 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SDCBP2Q9H190 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SDCBP2Q9H190 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SDCBP2Q9H190 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SDCBP2Q9H190 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SDCBP2Q9H190 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SDCBP2Q9H190 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SDCBP2Q9H190 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SDCBP2Q9H190 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SDCBP2Q9H190 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SDCBP2Q9H190 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SDCBP2Q9H190 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SDCBP2Q9H190 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SDCBP2Q9H190 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SDCBP2Q9H190 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SDCBP2Q9H190 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SDCBP2Q9H190 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SDCBP2Q9H190 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SDCBP2Q9H190 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SDCBP2Q9H190 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SDCBP2Q9H190 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SDCBP2Q9H190 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SDCBP2Q9H190 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SDCBP2Q9H190 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SDCBP2Q9H190 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SDCBP2Q9H190 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SDCBP2Q9H190 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SDCBP2Q9H190 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SDCBP2Q9H190 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SDCBP2Q9H190 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SDCBP2Q9H190 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms