Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ2

SHCBP1L, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHCBP1LQ9BZQ2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHCBP1LQ9BZQ2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHCBP1LQ9BZQ2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHCBP1LQ9BZQ2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHCBP1LQ9BZQ2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHCBP1LQ9BZQ2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SHCBP1LQ9BZQ2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHCBP1LQ9BZQ2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHCBP1LQ9BZQ2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHCBP1LQ9BZQ2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHCBP1LQ9BZQ2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHCBP1LQ9BZQ2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHCBP1LQ9BZQ2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHCBP1LQ9BZQ2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHCBP1LQ9BZQ2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHCBP1LQ9BZQ2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHCBP1LQ9BZQ2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHCBP1LQ9BZQ2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHCBP1LQ9BZQ2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHCBP1LQ9BZQ2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHCBP1LQ9BZQ2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHCBP1LQ9BZQ2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHCBP1LQ9BZQ2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHCBP1LQ9BZQ2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHCBP1LQ9BZQ2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHCBP1LQ9BZQ2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHCBP1LQ9BZQ2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHCBP1LQ9BZQ2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHCBP1LQ9BZQ2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHCBP1LQ9BZQ2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHCBP1LQ9BZQ2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHCBP1LQ9BZQ2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHCBP1LQ9BZQ2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHCBP1LQ9BZQ2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHCBP1LQ9BZQ2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHCBP1LQ9BZQ2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHCBP1LQ9BZQ2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHCBP1LQ9BZQ2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHCBP1LQ9BZQ2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHCBP1LQ9BZQ2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHCBP1LQ9BZQ2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHCBP1LQ9BZQ2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHCBP1LQ9BZQ2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHCBP1LQ9BZQ2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHCBP1LQ9BZQ2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHCBP1LQ9BZQ2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHCBP1LQ9BZQ2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHCBP1LQ9BZQ2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHCBP1LQ9BZQ2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHCBP1LQ9BZQ2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SHCBP1LQ9BZQ2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHCBP1LQ9BZQ2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHCBP1LQ9BZQ2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHCBP1LQ9BZQ2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHCBP1LQ9BZQ2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHCBP1LQ9BZQ2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHCBP1LQ9BZQ2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHCBP1LQ9BZQ2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHCBP1LQ9BZQ2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHCBP1LQ9BZQ2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHCBP1LQ9BZQ2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHCBP1LQ9BZQ2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHCBP1LQ9BZQ2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHCBP1LQ9BZQ2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SHCBP1LQ9BZQ2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHCBP1LQ9BZQ2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHCBP1LQ9BZQ2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHCBP1LQ9BZQ2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHCBP1LQ9BZQ2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHCBP1LQ9BZQ2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHCBP1LQ9BZQ2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHCBP1LQ9BZQ2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHCBP1LQ9BZQ2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHCBP1LQ9BZQ2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SHCBP1LQ9BZQ2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHCBP1LQ9BZQ2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHCBP1LQ9BZQ2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHCBP1LQ9BZQ2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHCBP1LQ9BZQ2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SHCBP1LQ9BZQ2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHCBP1LQ9BZQ2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHCBP1LQ9BZQ2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHCBP1LQ9BZQ2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHCBP1LQ9BZQ2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SHCBP1LQ9BZQ2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHCBP1LQ9BZQ2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHCBP1LQ9BZQ2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHCBP1LQ9BZQ2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHCBP1LQ9BZQ2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHCBP1LQ9BZQ2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHCBP1LQ9BZQ2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHCBP1LQ9BZQ2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHCBP1LQ9BZQ2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SHCBP1LQ9BZQ2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHCBP1LQ9BZQ2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHCBP1LQ9BZQ2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHCBP1LQ9BZQ2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHCBP1LQ9BZQ2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SHCBP1LQ9BZQ2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.9 ms