Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BARHL1Q9BZE3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BARHL1Q9BZE3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BARHL1Q9BZE3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BARHL1Q9BZE3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BARHL1Q9BZE3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BARHL1Q9BZE3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BARHL1Q9BZE3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BARHL1Q9BZE3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BARHL1Q9BZE3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BARHL1Q9BZE3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
BARHL1Q9BZE3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
BARHL1Q9BZE3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms