Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP5Q9BXF6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP5Q9BXF6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP5Q9BXF6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP5Q9BXF6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP5Q9BXF6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP5Q9BXF6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP5Q9BXF6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP5Q9BXF6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB11FIP5Q9BXF6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP5Q9BXF6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP5Q9BXF6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP5Q9BXF6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP5Q9BXF6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP5Q9BXF6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP5Q9BXF6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP5Q9BXF6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP5Q9BXF6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP5Q9BXF6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP5Q9BXF6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP5Q9BXF6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP5Q9BXF6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP5Q9BXF6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP5Q9BXF6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP5Q9BXF6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP5Q9BXF6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP5Q9BXF6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP5Q9BXF6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP5Q9BXF6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP5Q9BXF6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP5Q9BXF6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP5Q9BXF6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP5Q9BXF6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP5Q9BXF6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP5Q9BXF6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAB11FIP5Q9BXF6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB11FIP5Q9BXF6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB11FIP5Q9BXF6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB11FIP5Q9BXF6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB11FIP5Q9BXF6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB11FIP5Q9BXF6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB11FIP5Q9BXF6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB11FIP5Q9BXF6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB11FIP5Q9BXF6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB11FIP5Q9BXF6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP5Q9BXF6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP5Q9BXF6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP5Q9BXF6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB11FIP5Q9BXF6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB11FIP5Q9BXF6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB11FIP5Q9BXF6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB11FIP5Q9BXF6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB11FIP5Q9BXF6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB11FIP5Q9BXF6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB11FIP5Q9BXF6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB11FIP5Q9BXF6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP5Q9BXF6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP5Q9BXF6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP5Q9BXF6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP5Q9BXF6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB11FIP5Q9BXF6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB11FIP5Q9BXF6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB11FIP5Q9BXF6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB11FIP5Q9BXF6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP5Q9BXF6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP5Q9BXF6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP5Q9BXF6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP5Q9BXF6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP5Q9BXF6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP5Q9BXF6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP5Q9BXF6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP5Q9BXF6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP5Q9BXF6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP5Q9BXF6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP5Q9BXF6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP5Q9BXF6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB11FIP5Q9BXF6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB11FIP5Q9BXF6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAB11FIP5Q9BXF6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
RAB11FIP5Q9BXF6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB11FIP5Q9BXF6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB11FIP5Q9BXF6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP5Q9BXF6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP5Q9BXF6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.1 ms