Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ6

PIMREG, Protein PIMREG, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIMREGQ9BSJ6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PIMREGQ9BSJ6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
PIMREGQ9BSJ6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIMREGQ9BSJ6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIMREGQ9BSJ6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PIMREGQ9BSJ6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PIMREGQ9BSJ6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIMREGQ9BSJ6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PIMREGQ9BSJ6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PIMREGQ9BSJ6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PIMREGQ9BSJ6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PIMREGQ9BSJ6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIMREGQ9BSJ6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIMREGQ9BSJ6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIMREGQ9BSJ6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIMREGQ9BSJ6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PIMREGQ9BSJ6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PIMREGQ9BSJ6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIMREGQ9BSJ6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PIMREGQ9BSJ6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIMREGQ9BSJ6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIMREGQ9BSJ6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PIMREGQ9BSJ6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PIMREGQ9BSJ6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PIMREGQ9BSJ6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PIMREGQ9BSJ6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIMREGQ9BSJ6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIMREGQ9BSJ6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIMREGQ9BSJ6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PIMREGQ9BSJ6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIMREGQ9BSJ6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIMREGQ9BSJ6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIMREGQ9BSJ6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PIMREGQ9BSJ6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PIMREGQ9BSJ6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIMREGQ9BSJ6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIMREGQ9BSJ6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIMREGQ9BSJ6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIMREGQ9BSJ6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIMREGQ9BSJ6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PIMREGQ9BSJ6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIMREGQ9BSJ6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIMREGQ9BSJ6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIMREGQ9BSJ6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIMREGQ9BSJ6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIMREGQ9BSJ6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIMREGQ9BSJ6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PIMREGQ9BSJ6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIMREGQ9BSJ6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIMREGQ9BSJ6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIMREGQ9BSJ6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIMREGQ9BSJ6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIMREGQ9BSJ6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIMREGQ9BSJ6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIMREGQ9BSJ6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIMREGQ9BSJ6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIMREGQ9BSJ6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIMREGQ9BSJ6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIMREGQ9BSJ6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIMREGQ9BSJ6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIMREGQ9BSJ6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PIMREGQ9BSJ6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIMREGQ9BSJ6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIMREGQ9BSJ6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIMREGQ9BSJ6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIMREGQ9BSJ6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIMREGQ9BSJ6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIMREGQ9BSJ6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIMREGQ9BSJ6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIMREGQ9BSJ6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIMREGQ9BSJ6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIMREGQ9BSJ6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIMREGQ9BSJ6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIMREGQ9BSJ6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PIMREGQ9BSJ6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIMREGQ9BSJ6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PIMREGQ9BSJ6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PIMREGQ9BSJ6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PIMREGQ9BSJ6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PIMREGQ9BSJ6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PIMREGQ9BSJ6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIMREGQ9BSJ6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PIMREGQ9BSJ6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIMREGQ9BSJ6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIMREGQ9BSJ6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIMREGQ9BSJ6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIMREGQ9BSJ6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIMREGQ9BSJ6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PIMREGQ9BSJ6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIMREGQ9BSJ6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIMREGQ9BSJ6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIMREGQ9BSJ6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIMREGQ9BSJ6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIMREGQ9BSJ6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIMREGQ9BSJ6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIMREGQ9BSJ6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIMREGQ9BSJ6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIMREGQ9BSJ6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIMREGQ9BSJ6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIMREGQ9BSJ6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms