Protein–RNA interactions for Protein: Q99986

VRK1, Serine/threonine-protein kinase VRK1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VRK1Q99986 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VRK1Q99986 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VRK1Q99986 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VRK1Q99986 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VRK1Q99986 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VRK1Q99986 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VRK1Q99986 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VRK1Q99986 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VRK1Q99986 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VRK1Q99986 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VRK1Q99986 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VRK1Q99986 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VRK1Q99986 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VRK1Q99986 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VRK1Q99986 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VRK1Q99986 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VRK1Q99986 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VRK1Q99986 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VRK1Q99986 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VRK1Q99986 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VRK1Q99986 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VRK1Q99986 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VRK1Q99986 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VRK1Q99986 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VRK1Q99986 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VRK1Q99986 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VRK1Q99986 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VRK1Q99986 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VRK1Q99986 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VRK1Q99986 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VRK1Q99986 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VRK1Q99986 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VRK1Q99986 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VRK1Q99986 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VRK1Q99986 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VRK1Q99986 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VRK1Q99986 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VRK1Q99986 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VRK1Q99986 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VRK1Q99986 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VRK1Q99986 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VRK1Q99986 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VRK1Q99986 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VRK1Q99986 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VRK1Q99986 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VRK1Q99986 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VRK1Q99986 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VRK1Q99986 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VRK1Q99986 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VRK1Q99986 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VRK1Q99986 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VRK1Q99986 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VRK1Q99986 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VRK1Q99986 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VRK1Q99986 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VRK1Q99986 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VRK1Q99986 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VRK1Q99986 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VRK1Q99986 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VRK1Q99986 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
VRK1Q99986 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VRK1Q99986 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VRK1Q99986 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VRK1Q99986 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VRK1Q99986 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VRK1Q99986 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VRK1Q99986 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms