Protein–RNA interactions for Protein: Q99946

PRRT1, Proline-rich transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1Q99946 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRT1Q99946 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRT1Q99946 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRT1Q99946 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRT1Q99946 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRT1Q99946 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRT1Q99946 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRT1Q99946 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRT1Q99946 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRT1Q99946 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRT1Q99946 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRRT1Q99946 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRRT1Q99946 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRRT1Q99946 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRRT1Q99946 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRRT1Q99946 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRRT1Q99946 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRRT1Q99946 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRRT1Q99946 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRRT1Q99946 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRRT1Q99946 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRRT1Q99946 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRRT1Q99946 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRRT1Q99946 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRRT1Q99946 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRRT1Q99946 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PRRT1Q99946 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRRT1Q99946 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRRT1Q99946 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PRRT1Q99946 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRRT1Q99946 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRRT1Q99946 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRRT1Q99946 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRRT1Q99946 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRRT1Q99946 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRRT1Q99946 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRRT1Q99946 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRRT1Q99946 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRRT1Q99946 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRT1Q99946 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRT1Q99946 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRT1Q99946 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRT1Q99946 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRT1Q99946 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRT1Q99946 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRT1Q99946 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRT1Q99946 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRT1Q99946 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRT1Q99946 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRT1Q99946 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRT1Q99946 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRT1Q99946 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRT1Q99946 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRT1Q99946 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRT1Q99946 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRT1Q99946 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRT1Q99946 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRT1Q99946 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRT1Q99946 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRT1Q99946 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRT1Q99946 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRT1Q99946 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRRT1Q99946 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRRT1Q99946 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRRT1Q99946 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRRT1Q99946 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRRT1Q99946 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRRT1Q99946 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRRT1Q99946 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRRT1Q99946 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRRT1Q99946 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRRT1Q99946 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRRT1Q99946 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRRT1Q99946 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRRT1Q99946 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRRT1Q99946 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRRT1Q99946 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRRT1Q99946 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRRT1Q99946 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRRT1Q99946 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRRT1Q99946 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRRT1Q99946 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRRT1Q99946 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRRT1Q99946 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRRT1Q99946 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRRT1Q99946 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRRT1Q99946 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRRT1Q99946 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRRT1Q99946 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRRT1Q99946 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRRT1Q99946 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRRT1Q99946 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRRT1Q99946 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRRT1Q99946 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRRT1Q99946 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRRT1Q99946 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRRT1Q99946 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRRT1Q99946 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRRT1Q99946 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRRT1Q99946 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms