Protein–RNA interactions for Protein: Q99788

CMKLR1, Chemokine-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMKLR1Q99788 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CMKLR1Q99788 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CMKLR1Q99788 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CMKLR1Q99788 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CMKLR1Q99788 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CMKLR1Q99788 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CMKLR1Q99788 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CMKLR1Q99788 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CMKLR1Q99788 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CMKLR1Q99788 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CMKLR1Q99788 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CMKLR1Q99788 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CMKLR1Q99788 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CMKLR1Q99788 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CMKLR1Q99788 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CMKLR1Q99788 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CMKLR1Q99788 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CMKLR1Q99788 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CMKLR1Q99788 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CMKLR1Q99788 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CMKLR1Q99788 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CMKLR1Q99788 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CMKLR1Q99788 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CMKLR1Q99788 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CMKLR1Q99788 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CMKLR1Q99788 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CMKLR1Q99788 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CMKLR1Q99788 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CMKLR1Q99788 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CMKLR1Q99788 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CMKLR1Q99788 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CMKLR1Q99788 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CMKLR1Q99788 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CMKLR1Q99788 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CMKLR1Q99788 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CMKLR1Q99788 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CMKLR1Q99788 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CMKLR1Q99788 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CMKLR1Q99788 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CMKLR1Q99788 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CMKLR1Q99788 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CMKLR1Q99788 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CMKLR1Q99788 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CMKLR1Q99788 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CMKLR1Q99788 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CMKLR1Q99788 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CMKLR1Q99788 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CMKLR1Q99788 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CMKLR1Q99788 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CMKLR1Q99788 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CMKLR1Q99788 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CMKLR1Q99788 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CMKLR1Q99788 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CMKLR1Q99788 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CMKLR1Q99788 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMKLR1Q99788 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMKLR1Q99788 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMKLR1Q99788 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMKLR1Q99788 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMKLR1Q99788 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMKLR1Q99788 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMKLR1Q99788 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CMKLR1Q99788 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CMKLR1Q99788 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CMKLR1Q99788 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CMKLR1Q99788 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CMKLR1Q99788 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CMKLR1Q99788 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CMKLR1Q99788 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CMKLR1Q99788 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CMKLR1Q99788 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CMKLR1Q99788 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CMKLR1Q99788 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CMKLR1Q99788 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CMKLR1Q99788 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CMKLR1Q99788 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CMKLR1Q99788 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CMKLR1Q99788 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CMKLR1Q99788 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CMKLR1Q99788 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CMKLR1Q99788 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CMKLR1Q99788 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CMKLR1Q99788 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CMKLR1Q99788 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CMKLR1Q99788 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CMKLR1Q99788 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CMKLR1Q99788 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CMKLR1Q99788 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CMKLR1Q99788 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CMKLR1Q99788 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CMKLR1Q99788 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CMKLR1Q99788 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CMKLR1Q99788 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CMKLR1Q99788 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CMKLR1Q99788 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CMKLR1Q99788 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CMKLR1Q99788 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CMKLR1Q99788 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CMKLR1Q99788 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CMKLR1Q99788 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms