Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC46.23■■■■■ 4.99
RSF1Q96T23 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
RSF1Q96T23 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC46.22■■■■■ 4.99
RSF1Q96T23 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC46.21■■■■■ 4.99
RSF1Q96T23 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.99
RSF1Q96T23 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.98
RSF1Q96T23 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.98
RSF1Q96T23 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.19■■■■■ 4.98
RSF1Q96T23 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC46.19■■■■■ 4.98
RSF1Q96T23 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC46.18■■■■■ 4.98
RSF1Q96T23 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
RSF1Q96T23 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC46.18■■■■■ 4.98
RSF1Q96T23 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.17■■■■■ 4.98
RSF1Q96T23 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
RSF1Q96T23 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
RSF1Q96T23 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
RSF1Q96T23 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC46.15■■■■■ 4.98
RSF1Q96T23 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.15■■■■■ 4.98
RSF1Q96T23 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
RSF1Q96T23 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC46.14■■■■■ 4.98
RSF1Q96T23 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC46.13■■■■■ 4.98
RSF1Q96T23 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
RSF1Q96T23 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
RSF1Q96T23 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC46.11■■■■■ 4.97
RSF1Q96T23 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
RSF1Q96T23 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC46.1■■■■■ 4.97
RSF1Q96T23 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC46.1■■■■■ 4.97
RSF1Q96T23 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
RSF1Q96T23 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
RSF1Q96T23 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
RSF1Q96T23 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC46.09■■■■■ 4.97
RSF1Q96T23 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
RSF1Q96T23 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC46.09■■■■■ 4.97
RSF1Q96T23 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC46.08■■■■■ 4.97
RSF1Q96T23 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
RSF1Q96T23 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
RSF1Q96T23 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.96
RSF1Q96T23 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC46.06■■■■■ 4.96
RSF1Q96T23 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
RSF1Q96T23 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC46.04■■■■■ 4.96
RSF1Q96T23 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
RSF1Q96T23 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC46.03■■■■■ 4.96
RSF1Q96T23 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC46.02■■■■■ 4.96
RSF1Q96T23 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC46.02■■■■■ 4.96
RSF1Q96T23 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
RSF1Q96T23 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC46.01■■■■■ 4.96
RSF1Q96T23 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.01■■■■■ 4.96
RSF1Q96T23 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
RSF1Q96T23 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
RSF1Q96T23 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
RSF1Q96T23 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC45.99■■■■■ 4.95
RSF1Q96T23 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
RSF1Q96T23 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
RSF1Q96T23 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.99■■■■■ 4.95
RSF1Q96T23 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC45.99■■■■■ 4.95
RSF1Q96T23 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC45.98■■■■■ 4.95
RSF1Q96T23 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
RSF1Q96T23 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC45.97■■■■■ 4.95
RSF1Q96T23 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
RSF1Q96T23 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC45.96■■■■■ 4.95
RSF1Q96T23 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC45.95■■■■■ 4.95
RSF1Q96T23 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.94
RSF1Q96T23 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.94
RSF1Q96T23 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC45.93■■■■■ 4.94
RSF1Q96T23 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC45.93■■■■■ 4.94
RSF1Q96T23 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
RSF1Q96T23 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC45.91■■■■■ 4.94
RSF1Q96T23 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC45.91■■■■■ 4.94
RSF1Q96T23 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
RSF1Q96T23 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
RSF1Q96T23 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC45.87■■■■■ 4.93
RSF1Q96T23 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
RSF1Q96T23 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.86■■■■■ 4.93
RSF1Q96T23 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC45.86■■■■■ 4.93
RSF1Q96T23 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
RSF1Q96T23 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
RSF1Q96T23 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
RSF1Q96T23 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
RSF1Q96T23 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
RSF1Q96T23 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
RSF1Q96T23 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
RSF1Q96T23 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC45.82■■■■■ 4.93
RSF1Q96T23 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC45.82■■■■■ 4.93
RSF1Q96T23 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
RSF1Q96T23 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC45.81■■■■■ 4.92
RSF1Q96T23 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
RSF1Q96T23 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
RSF1Q96T23 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
RSF1Q96T23 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
RSF1Q96T23 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC45.77■■■■■ 4.92
RSF1Q96T23 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC45.77■■■■■ 4.92
RSF1Q96T23 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC45.76■■■■■ 4.92
RSF1Q96T23 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
RSF1Q96T23 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
RSF1Q96T23 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC45.75■■■■■ 4.92
RSF1Q96T23 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.74■■■■■ 4.91
RSF1Q96T23 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC45.74■■■■■ 4.91
RSF1Q96T23 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
RSF1Q96T23 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC45.73■■■■■ 4.91
RSF1Q96T23 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC45.73■■■■■ 4.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms