Protein–RNA interactions for Protein: Q96HF1

SFRP2, Secreted frizzled-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2Q96HF1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SFRP2Q96HF1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SFRP2Q96HF1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SFRP2Q96HF1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SFRP2Q96HF1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SFRP2Q96HF1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SFRP2Q96HF1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SFRP2Q96HF1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SFRP2Q96HF1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SFRP2Q96HF1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SFRP2Q96HF1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SFRP2Q96HF1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SFRP2Q96HF1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SFRP2Q96HF1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SFRP2Q96HF1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SFRP2Q96HF1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SFRP2Q96HF1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SFRP2Q96HF1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SFRP2Q96HF1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SFRP2Q96HF1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SFRP2Q96HF1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SFRP2Q96HF1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SFRP2Q96HF1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SFRP2Q96HF1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SFRP2Q96HF1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SFRP2Q96HF1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SFRP2Q96HF1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SFRP2Q96HF1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFRP2Q96HF1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFRP2Q96HF1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFRP2Q96HF1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFRP2Q96HF1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFRP2Q96HF1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFRP2Q96HF1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFRP2Q96HF1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFRP2Q96HF1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFRP2Q96HF1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFRP2Q96HF1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFRP2Q96HF1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFRP2Q96HF1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFRP2Q96HF1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFRP2Q96HF1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFRP2Q96HF1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFRP2Q96HF1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFRP2Q96HF1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFRP2Q96HF1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFRP2Q96HF1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFRP2Q96HF1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFRP2Q96HF1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFRP2Q96HF1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFRP2Q96HF1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFRP2Q96HF1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFRP2Q96HF1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFRP2Q96HF1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFRP2Q96HF1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFRP2Q96HF1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFRP2Q96HF1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFRP2Q96HF1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFRP2Q96HF1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SFRP2Q96HF1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFRP2Q96HF1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SFRP2Q96HF1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms