Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX6

LRRC58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC58Q96CX6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC58Q96CX6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC58Q96CX6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC58Q96CX6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC58Q96CX6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC58Q96CX6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC58Q96CX6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC58Q96CX6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC58Q96CX6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC58Q96CX6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC58Q96CX6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC58Q96CX6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC58Q96CX6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC58Q96CX6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC58Q96CX6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC58Q96CX6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC58Q96CX6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC58Q96CX6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC58Q96CX6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC58Q96CX6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC58Q96CX6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC58Q96CX6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC58Q96CX6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC58Q96CX6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC58Q96CX6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC58Q96CX6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC58Q96CX6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC58Q96CX6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC58Q96CX6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC58Q96CX6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC58Q96CX6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC58Q96CX6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC58Q96CX6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC58Q96CX6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC58Q96CX6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC58Q96CX6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC58Q96CX6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC58Q96CX6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC58Q96CX6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC58Q96CX6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC58Q96CX6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC58Q96CX6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC58Q96CX6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC58Q96CX6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC58Q96CX6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC58Q96CX6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC58Q96CX6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC58Q96CX6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC58Q96CX6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC58Q96CX6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC58Q96CX6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC58Q96CX6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC58Q96CX6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC58Q96CX6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC58Q96CX6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC58Q96CX6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC58Q96CX6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC58Q96CX6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC58Q96CX6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC58Q96CX6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC58Q96CX6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC58Q96CX6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC58Q96CX6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC58Q96CX6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC58Q96CX6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC58Q96CX6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC58Q96CX6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC58Q96CX6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC58Q96CX6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC58Q96CX6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC58Q96CX6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC58Q96CX6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC58Q96CX6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC58Q96CX6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC58Q96CX6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC58Q96CX6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC58Q96CX6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRRC58Q96CX6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC58Q96CX6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC58Q96CX6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC58Q96CX6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC58Q96CX6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC58Q96CX6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC58Q96CX6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC58Q96CX6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC58Q96CX6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC58Q96CX6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC58Q96CX6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC58Q96CX6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC58Q96CX6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC58Q96CX6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC58Q96CX6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC58Q96CX6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC58Q96CX6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC58Q96CX6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC58Q96CX6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC58Q96CX6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC58Q96CX6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC58Q96CX6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC58Q96CX6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms