Protein–RNA interactions for Protein: Q96A83

COL26A1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL26A1Q96A83 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL26A1Q96A83 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL26A1Q96A83 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL26A1Q96A83 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL26A1Q96A83 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL26A1Q96A83 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL26A1Q96A83 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL26A1Q96A83 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL26A1Q96A83 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL26A1Q96A83 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL26A1Q96A83 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL26A1Q96A83 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL26A1Q96A83 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL26A1Q96A83 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL26A1Q96A83 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL26A1Q96A83 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL26A1Q96A83 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL26A1Q96A83 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL26A1Q96A83 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
COL26A1Q96A83 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL26A1Q96A83 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL26A1Q96A83 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL26A1Q96A83 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL26A1Q96A83 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
COL26A1Q96A83 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL26A1Q96A83 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL26A1Q96A83 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL26A1Q96A83 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL26A1Q96A83 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL26A1Q96A83 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
COL26A1Q96A83 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL26A1Q96A83 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL26A1Q96A83 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL26A1Q96A83 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL26A1Q96A83 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL26A1Q96A83 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL26A1Q96A83 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL26A1Q96A83 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL26A1Q96A83 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL26A1Q96A83 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL26A1Q96A83 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL26A1Q96A83 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL26A1Q96A83 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
COL26A1Q96A83 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL26A1Q96A83 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL26A1Q96A83 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL26A1Q96A83 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL26A1Q96A83 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL26A1Q96A83 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COL26A1Q96A83 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL26A1Q96A83 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL26A1Q96A83 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL26A1Q96A83 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL26A1Q96A83 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL26A1Q96A83 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL26A1Q96A83 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL26A1Q96A83 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL26A1Q96A83 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL26A1Q96A83 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL26A1Q96A83 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL26A1Q96A83 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL26A1Q96A83 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL26A1Q96A83 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL26A1Q96A83 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL26A1Q96A83 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL26A1Q96A83 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL26A1Q96A83 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL26A1Q96A83 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL26A1Q96A83 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL26A1Q96A83 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL26A1Q96A83 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL26A1Q96A83 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL26A1Q96A83 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL26A1Q96A83 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL26A1Q96A83 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL26A1Q96A83 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL26A1Q96A83 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL26A1Q96A83 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL26A1Q96A83 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL26A1Q96A83 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL26A1Q96A83 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL26A1Q96A83 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL26A1Q96A83 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL26A1Q96A83 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL26A1Q96A83 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL26A1Q96A83 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL26A1Q96A83 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL26A1Q96A83 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL26A1Q96A83 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
COL26A1Q96A83 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL26A1Q96A83 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL26A1Q96A83 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL26A1Q96A83 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL26A1Q96A83 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL26A1Q96A83 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
COL26A1Q96A83 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL26A1Q96A83 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL26A1Q96A83 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL26A1Q96A83 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL26A1Q96A83 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms