Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf40Q8WZ69 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf40Q8WZ69 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C11orf40Q8WZ69 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C11orf40Q8WZ69 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C11orf40Q8WZ69 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C11orf40Q8WZ69 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C11orf40Q8WZ69 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C11orf40Q8WZ69 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C11orf40Q8WZ69 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C11orf40Q8WZ69 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C11orf40Q8WZ69 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C11orf40Q8WZ69 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C11orf40Q8WZ69 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C11orf40Q8WZ69 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C11orf40Q8WZ69 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C11orf40Q8WZ69 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C11orf40Q8WZ69 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C11orf40Q8WZ69 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C11orf40Q8WZ69 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C11orf40Q8WZ69 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C11orf40Q8WZ69 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C11orf40Q8WZ69 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C11orf40Q8WZ69 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C11orf40Q8WZ69 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C11orf40Q8WZ69 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C11orf40Q8WZ69 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C11orf40Q8WZ69 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C11orf40Q8WZ69 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C11orf40Q8WZ69 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C11orf40Q8WZ69 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C11orf40Q8WZ69 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C11orf40Q8WZ69 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C11orf40Q8WZ69 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C11orf40Q8WZ69 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C11orf40Q8WZ69 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C11orf40Q8WZ69 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C11orf40Q8WZ69 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C11orf40Q8WZ69 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C11orf40Q8WZ69 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C11orf40Q8WZ69 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C11orf40Q8WZ69 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C11orf40Q8WZ69 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C11orf40Q8WZ69 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C11orf40Q8WZ69 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C11orf40Q8WZ69 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C11orf40Q8WZ69 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C11orf40Q8WZ69 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C11orf40Q8WZ69 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C11orf40Q8WZ69 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C11orf40Q8WZ69 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf40Q8WZ69 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf40Q8WZ69 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf40Q8WZ69 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf40Q8WZ69 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf40Q8WZ69 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf40Q8WZ69 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf40Q8WZ69 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf40Q8WZ69 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf40Q8WZ69 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf40Q8WZ69 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf40Q8WZ69 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf40Q8WZ69 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf40Q8WZ69 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf40Q8WZ69 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf40Q8WZ69 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf40Q8WZ69 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf40Q8WZ69 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf40Q8WZ69 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf40Q8WZ69 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C11orf40Q8WZ69 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C11orf40Q8WZ69 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C11orf40Q8WZ69 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C11orf40Q8WZ69 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C11orf40Q8WZ69 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C11orf40Q8WZ69 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C11orf40Q8WZ69 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C11orf40Q8WZ69 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C11orf40Q8WZ69 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C11orf40Q8WZ69 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C11orf40Q8WZ69 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C11orf40Q8WZ69 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf40Q8WZ69 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf40Q8WZ69 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf40Q8WZ69 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf40Q8WZ69 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf40Q8WZ69 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf40Q8WZ69 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf40Q8WZ69 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf40Q8WZ69 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf40Q8WZ69 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C11orf40Q8WZ69 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C11orf40Q8WZ69 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C11orf40Q8WZ69 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C11orf40Q8WZ69 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C11orf40Q8WZ69 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C11orf40Q8WZ69 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C11orf40Q8WZ69 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf40Q8WZ69 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf40Q8WZ69 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
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